Question

我对xarray中的时间变量有误解。我有一个带有时间的netcdf4文件，因为无限维度和变量（例如坐标变量）都是这样定义的：

   double time(time=59231);
     :_Netcdf4Dimid = 0; // int
     :units = "seconds since 2015-11-12 16:1:48.500000 0:00";

文件中还存储了EPIC约定时间（因为我在这里测试代码的惯例之间仍然来回）

 int EPIC_time(time=59231);
     :units = "True Julian Day";
     :epic_code = 624; // int
     :datum = "Time (UTC) in True Julian Days: 2440000 = 0000 h on May 23, 1968";
     :NOTE = "Decimal Julian day [days] = time [days] + ( time2 [msec] / 86400000 [msec/day] )";
     :_Netcdf4Dimid = 0; // int
     :serial_number = "23881";
     :sensor_type = "TRDI";
     :sensor_depth = 10.367607116699219; // double
     :initial_sensor_height = 1; // int
     :initial_sensor_height_note = "height in meters above bottom:  accurate for tripod mounted instruments";
     :height_depth_units = "m";
     :_FillValue = -1; // int
     :_Unsigned = "true";

还有一个带有乐器标题的变量：

float Hdg_1215(time=59231, lat=1, lon=1);
     :_FillValue = 1.0E35f; // float
     :units = "degrees";
     :name = "Hdg";

要打开文件并使用它，我会这样做：

import xarray as xr
import numpy as np
import datetime as dt
vars2omit = {'EPIC_time','EPIC_time2'}
ds = xr.open_dataset(infile,decode_times=True,drop_variables=vars2omit)

我可以使用数据进行绘图和处理。但是有两种非常奇怪的行为，其中的解释将有助于我理解xarray的内部运作。

文件打开后，尝试访问时间变量（坐标时间变量）的units属性失败。为什么？该属性位于文件中。

print(ds['Hdg_1215'].attrs['units']) # this works
print(ds['time'].attrs['units']) # this fails, KeyError: 'units'

Answer 1

xarray自动将其理解的时间变量解码为坐标变量datetime64对象，因此units不合适。

如果你告诉它decode_times=False，它就不会创建datetime64对象并为你留下一个简单的数字数组，为解释这些数字需要units 。

以下是一个例子：

import xarray as xr
url ='http://geoport.whoi.edu/thredds/dodsC/usgs/data2/emontgomery/stellwagen/CF-1.6/ARGO_MERCHANT/1211P-A.cdf'
xr.open_dataset(url)

产生

<xarray.Dataset>
Dimensions:                (time: 10748)
Coordinates:
    latitude               float32 ...
    longitude              float32 ...
  * time                   (time) datetime64[ns] 1977-01-08T11:33:44 ...
    z                      float64 ...
Data variables:
    feature_type_instance  |S64 ...
    crs                    int32 ...
...

而

 xr.open_dataset(url, decode_times=False)

产生：

<xarray.Dataset>
Dimensions:                (time: 10748)
Coordinates:
    latitude               float32 ...
    longitude              float32 ...
  * time                   (time) float64 2.216e+08 2.216e+08 2.216e+08 ...
    z                      float64 ...
Data variables:
    feature_type_instance  |S64 ...
    crs                    int32 ...

python xarray丢失时间变量的units属性

1 个答案: