我有一个大熊猫数据成名 <iframe width="900" height="506" src="https://www.youtube.com/v/NWCep6fo2y0" frameborder="0" allowfullscreen></iframe>
。它有很多缺失。丢弃行/或逐行不是一种选择。输入中位数,平均值或最常用的值也不是一种选择(因此,df
和/或pandas
的估算很难做到这一点。
我遇到了一个名为scikit
的简洁包(你可以找到它here)。但是我有一些问题。
以下是我的工作:
fancyimpute
但是,#the neccesary imports
import pandas as pd
import numpy as np
from fancyimpute import KNN
# df is my data frame with the missings. I keep only floats
df_numeric = = df.select_dtypes(include=[np.float])
# I now run fancyimpute KNN,
# it returns a np.array which I store as a pandas dataframe
df_filled = pd.DataFrame(KNN(3).complete(df_numeric))
是一个单一的向量,而不是填充的数据帧。如何通过插补来保持数据框?
我意识到,df_filled
需要fancyimpute
。因此,我使用numpay array
将df_numeric
转换为数组。
as_matrix()
输出是一个缺少列标签的数据框。有没有办法检索标签?
答案 0 :(得分:6)
在代码后添加以下行:
df_filled.columns = df_numeric.columns
df_filled.index = df_numeric.index
答案 1 :(得分:4)
我看到了对幻想的归咎和熊猫的无奈。这是使用递归覆盖方法的相当基本的包装器。接收并输出一个数据框-完整的列名。这种包装器可以很好地与管道配合使用。
DELIMITER //
CREATE TRIGGER before_insert_income
BEFORE INSERT ON income_30
FOR EACH ROW
BEGIN
IF NEW.income = (select income from income_30 where ID=NEW.ID and date=(select max(date) from income_30)) THEN
UPDATE income_30 set date = NEW.date where ID=NEW.ID;
END IF;
END; //
DELIMITER ;
答案 2 :(得分:2)
<div id="vir">
<p>Viridis colors</p>
</div>
由fancyimpute对象的df=pd.DataFrame(data=mice.complete(d), columns=d.columns, index=d.index)
方法返回的np.array
(无论是鼠标还是KNN)作为pandas数据帧的内容.complete()
提供,其中cols和索引是与原始数据框相同。
答案 3 :(得分:1)
我非常感谢@ jander081的方法,并在此方法上进行了一点扩展以处理设置分类列。我遇到了一个问题,即在训练过程中分类列会被设置为未设置并产生错误,因此,修改代码如下:
from fancyimpute import SoftImpute
import pandas as pd
class SoftImputeDf(SoftImpute):
"""DataFrame Wrapper around SoftImpute"""
def __init__(self, shrinkage_value=None, convergence_threshold=0.001,
max_iters=100,max_rank=None,n_power_iterations=1,init_fill_method="zero",
min_value=None,max_value=None,normalizer=None,verbose=True):
super(SoftImputeDf, self).__init__(shrinkage_value=shrinkage_value,
convergence_threshold=convergence_threshold,
max_iters=max_iters,max_rank=max_rank,
n_power_iterations=n_power_iterations,
init_fill_method=init_fill_method,
min_value=min_value,max_value=max_value,
normalizer=normalizer,verbose=False)
def fit_transform(self, X, y=None):
assert isinstance(X, pd.DataFrame), "Must be pandas dframe"
for col in X.columns:
if X[col].isnull().sum() < 10:
X[col].fillna(0.0, inplace=True)
z = super(SoftImputeDf, self).fit_transform(X.values)
df = pd.DataFrame(z, index=X.index, columns=X.columns)
cats = list(X.select_dtypes(include='category'))
df[cats] = df[cats].astype('category')
# return pd.DataFrame(z, index=X.index, columns=X.columns)
return df