我使用以下代码来组合keras生成的所有hdf5文件。
import h5py
output_file = h5py.File('output.h5', 'w')
#keep track of the total number of rows
total_rows = 0
import os
file_list = os.listdir(os.getcwd())
for n, f in enumerate(file_list):
your_data = h5py.File(n, 'r+')
total_rows = total_rows + your_data.shape[0]
total_columns = your_data.shape[1]
if n == 0:
#first file; create the dummy dataset with no max shape
create_dataset = output_file.create_dataset("Name", (total_rows, total_columns), maxshape=(None, None))
#fill the first section of the dataset
create_dataset[:,:] = your_data
where_to_start_appending = total_rows
else:
#resize the dataset to accomodate the new data
create_dataset.resize(total_rows, axis=0)
create_dataset[where_to_start_appending:total_rows, :] = your_data
where_to_start_appending = total_rows
output_file.close()
它引发了以下错误。
期望str字节或osPathLike对象。
为什么呢?我怎样才能组合keras的所有hdf5数据集?
答案 0 :(得分:2)
您正在处理类似数据集的HDF5文件。
f = h5py.File(n, 'r+')
your_data=f["Name_of_Dataset"] #open a dataset
total_rows = total_rows + your_data.shape[0]
如果您不知道数据集的名称,可以按如下方式获取
Dataset_Names=f.keys()
您还可以根据访问模式设置块大小来提高性能。现在您有自动分块,如果您使用可调整大小的数据集,则默认启用。