获取FactoMineR包中提供的eta2表

Question

我使用FactoMineR在生物数据集上执行PCA，其中每列是基因，行包含不同的样本。样品属于不同组（对照/治疗;癌症/非癌症）。我在应用PCA（）函数时将此信息作为定性补充包含在内，我有点理解当我们调用$ quali.sup $ eta2时，我们得到一个表格，其中包含每个分类变量与主体之间的平方相关性组件。我的问题是：该表格如何完全被删除 - 相关性如何精确计算？

Answer 1

p41上的包vingette将eta2标识为相关系数。

相关系数基于基础相关矩阵。

确切的方法应该在包裹作者提供的参考范围内。产生特征值和特征向量的方法通常是包不同但矩阵代数通常相同的。

  

Husson，F.，Le，S。和Pages，J。（2010）。利用R实例进行探索性多变量分析   查普曼和霍尔。

Answer 2

在样本坐标（FactoMineR术语中的个体）和表示为数值因子水平的分类变量之间计算相关性（平方）。