代码非常简单:
centrality = graph_tool.centrality.katz(Graph)
但有一些警告:
/usr/lib/python3/dist-packages/numpy/linalg/linalg.py:2056: RuntimeWarning: overflow encountered in multiply
return sqrt(add.reduce((x.conj() * x).real, axis=None))
/usr/lib/python3/dist-packages/graph_tool/centrality/__init__.py:765: RuntimeWarning: invalid value encountered in true_divide
vprop.fa = vprop.fa / numpy.linalg.norm(vprop.fa)
这些警告可能是由此图表的大小引起的,我该如何处理它。非常感谢。
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您可以使用以下方法禁用标准化步骤:
centrality = graph_tool.centrality.katz(Graph, norm=False)
然后,在标准化时,您可以先除以最大值:
centrality.fa /= centrality.fa.max()
centrality.fa /= numpy.linalg.norm(centrality.fa)