从RNetLogo加载带扩展名的Netlogo模型

Question

我正在尝试使用RNetLogo在无头模式下加载Netlogo模型。该模型使用由extensions [rnd]添加到模型的rnd扩展。如果我尝试使用NLLoad(model.path)加载模型，则会出现此错误：

NLLoadModel(model.path)
[1] "Java-Object{Can't find extension: rnd at position 79 in }"
Error in NLLoadModel(model.path) :`

不幸的是，我在documentation of NLLoad找不到任何内容。

我尝试将工作目录设置为Netlogo目录：setwd("/Applications/Netlogo 6.0.1")。这会将错误更改为

[1] "Java-Object{There was a problem while reading extension rnd at position 79 in }"
Fehler in NLLoadModel(model.path) : 

rnd扩展程序在扩展程序文件夹中安全无虞：/Applications/Netlogo 6.0.1/extensions/rnd.jar。

Answer 1

回应你的评论 - 这太糟糕了，但值得一试。也许这种方法只适用于从命令行运行无头。我也只是觉得你看起来像是在Mac上 - 我正在运行Windows，所以我的解决方案很可能不适合你。您是否在RNetlogo documentation？

中阅读了“MAC用户注释”

无论如何，我在Windows上有一个简单的版本，所以我想我会告诉你我的设置，看看是否有帮助。这是包含我的模型的文件夹，以及包含app的{​​{1}}文件夹和包含所有扩展名及其文件夹的netlogo-6.0.1.jar文件夹（从{{1}内复制完整文件夹）：

extensions如下：

app

然后，在R：

test_rnd.nlogo

所以在这个例子中，至少在Windows中，只是将扩展文件夹，app文件夹和模型文件本身放在同一个位置似乎都有效。抱歉，我不知道Mac的修复程序，希望其他人有正确的解决方案。

Answer 2

我通过将CSV扩展文件夹的内容直接复制到app文件夹中来完成此工作（使用CSV扩展名）。

我在GNU / Linux下工作。此方法对OSx用户也可能更好。我猜这是没有按预期工作，因为没有“安装”RNetLogo为我们设置类路径。我们明确告诉R在哪里可以找到netlogo-x.x.x.jar，但不能找到任何扩展。

Answer 3

在Mac上，此问题可以通过以下方法解决：

对于正在使用的每个NetLogo扩展，请将其复制并粘贴到包含您要运行的.nlogo模型的目录中。

例如，对于扩展名rnd，将文件夹/Applications/NetLogo 6.0.4/extensions/nw复制到model.path中设置的封闭文件夹中。 NLLoadModel(model.path)现在应该执行而不会出现此错误。

此解决方案基于Extensions Guide of the NetLogo 6.0.4 User Manual（添加了重点）：

  

NetLogo将在几个地方寻找扩展名：

     

  
1. 在当前模型的文件夹中。
  
2. NetLogo安装中的扩展文件夹。对于典型的NetLogo安装：      
     
   • 在Mac OS X上：/ Applications / NetLogo 6.0.4 / extensions
     
   • 在具有64位NetLogo的64位Windows或具有32位NetLogo的32位Windows上：C：\ Program Files \ NetLogo 6.0.4 \ app \ extensions
     
   • 在具有32位NetLogo的64位Windows上：C：\ Program Files（x86）\ NetLogo 6.0.4 \ app \ extensions
     
   • 在Linux上：从安装.tgz中提取的NetLogo目录的app / extensions子目录
     
  

我不清楚为什么对/Applications/NetLogo 6.0.4/extensions的检查不起作用，但至少有解决方案！

我在NetLogo中遇到了nw扩展名相同的问题，收到几乎相同的错误：

> NLLoadModel(model.path)
[1] "Java-Object{Can't find extension: nw at position 13 in }"
Error in NLLoadModel(model.path) :

因此，该问题似乎适用于所有扩展程序。