Question

我有一周的干净安装OS X（10.12.6），安装了新的R（3.4.1），rJava（0.9-8）和Oracle Java 8（1.8.0_144-b01）。我无法启动RNetLogo（1.0-4）（使用NLStart()）。另外，我的Netlogo版本是6.0.1。

我正在运行的代码是：

library(RNetLogo)

NLStart("/Applications/NetLogo 6.0.1/Java", 
  gui = FALSE, nl.jarname = "netlogo-6.0.1.jar")

我遇到的错误类似于许多其他人在此版本和之前版本的NetLogo和RNetLogo上遇到的错误（示例：1，2和＆amp; 3）。我已经尝试了在每个链接（上面）上推荐的所有修复程序，但没有找到一个让我超过此错误。

以下是错误消息：

java.lang.NoClassDefFoundError: org/nlogo/workspace/Controllable  
    at java.lang.Class.forName0(Native Method)
    at java.lang.Class.forName(Class.java:348)  
Caused by: java.lang.ClassNotFoundException 
    at RJavaClassLoader.findClass(RJavaClassLoader.java:383)  
    at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:424)  
    at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:357)  
    ... 2 more

上面的一个消息线程中，他们认为这是RNetLogo中的一个错误。这可能是真的，但我找不到与此软件包关联的活动消息板或错误/问题列表（正在定期维护）。

Answer 1

我联系了RNetLogo软件包维护者（Jan Thiele），他为我提供了一个基于R的替代启动程序，用于使用NetLogo GUI（来自德累斯顿大学的Robert Schlicht）。

以下是他们提供的启动过程的简化版本。要使其正常运行，您可能需要安装（或重新安装）最新版本的软件包：rJava，JGR和RNetLogo。

本质上，该过程使用基本R或RStudio启动不同的R环境（R-JGR的Java GUI），在Mac上与NetLogo一起工作。

以下是我如何启动JGR（您可能需要调整JDK版本号）：

#Load Java
 dyn.load("/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_144.jdk/Contents/Home/jre/lib/server/libjvm.dylib")
JGR::JGR() #Start JGR

然后在Java GUI for R（JGR）中启动NetLogo：

library(RNetLogo)
NLStart("/Applications/NetLogo 6.0.1/Java", nl.jarname = "netlogo-6.0.1.jar")

注意：

NLStart的nl.path参数需要“完整”路径。
最近发布了NetLogo 6.0.2，这个程序似乎也适用于该版本。

RNetLogo类错误

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