我想使用一些需要R版本3.4及更高版本的R软件包。我想通过rpy2（2.8）在python（3.6.1）中访问这些包。
我安装了R版本3.4，它位于/Library/Frameworks/R.framework/Resources但是，当我使用pip3 install rpy2安装并使用/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/bin/python3.6)中的python 3.6.1作为我的翻译时，我得到错误：
追踪（最近一次通话）： 文件“/Users/vincentliu/PycharmProjects/magic/rpy2tester.py”，第1行，in 来自rpy2 import robjects 文件“/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/rpy2/robjects/init.py”，第16行，in 将rpy2.rinterface导入为rinterface 文件“/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/rpy2/rinterface/init.py”，第92行， 来自rpy2.rinterface._rinterface import（baseenv， ImportError：dlopen（/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/rpy2/rinterface/_rinterface.cpython-36m-darwin.so,2）：未加载库：@rpath /libiconv.2.dylib 参考自：/ Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/rpy2/rinterface/_rinterface.cpython-36m-darwin.so 原因：库版本不兼容：_rinterface.cpython-36m-darwin.so需要8.0.0或更高版本，但libiconv.2.dylib提供版本7.0.0
首先看起来像Anaconda引起的问题，所以我删除了所有与Anaconda相关的文件，但问题仍然存在。
然后我卸载了rpy2，重新安装了Anaconda并使用conda install rpy2进行安装，这也通过Anaconda安装R版本3.3.2。然后我可以将解释器更改为/anaconda/bin/python并且可以使用rpy2，但我无法使用我关心的R包，因为它们需要R版本3.4及更高版本。显然，Anaconda可以安装的最旧版本是3.3.2，那么有什么方法可以使用Rpy2和R版本3.4？
我可以看到这个问题的两个通用解决方案。一种是通过conda安装rpy2，然后以某种方式将其依赖R更改为系统中的3.4。另一种解决方案是解决错误
库版本不兼容：_rinterface.cpython-36m-darwin.so需要8.0.0或更高版本，但libiconv.2.dylib提供版本7.0.0
经过多次努力，我发现两者都没有好结果。
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我卸载了rpy2并重新安装了--verborse。然后我找到了
ld：警告：忽略文件/opt/local/lib/libpcre.dylib，文件是为x86_64构建的，而不是被链接的体系结构（i386）：/ opt / local / lib / libpcre.dylib ld：警告：忽略文件/opt/local/lib/liblzma.dylib，文件是为x86_64构建的，它不是被链接的体系结构（i386）：/ opt / local / lib / liblzma.dylib ld：警告：忽略文件/opt/local/lib/libbz2.dylib，文件是为x86_64构建的，它不是被链接的体系结构（i386）：/ opt / local / lib / libbz2.dylib ld：警告：忽略文件/opt/local/lib/libz.dylib，文件是为x86_64构建的，它不是被链接的体系结构（i386）：/ opt / local / lib / libz.dylib ld：警告：忽略文件/opt/local/lib/libiconv.dylib，文件是为x86_64构建的，它不是被链接的体系结构（i386）：/ opt / local / lib / libiconv.dylib ld：警告：忽略文件/opt/local/lib/libicuuc.dylib，文件是为x86_64构建的，它不是被链接的体系结构（i386）：/ opt / local / lib / libicuuc.dylib ld：警告：忽略文件/opt/local/lib/libicui18n.dylib，文件是为x86_64构建的，它不是被链接的体系结构（i386）：/ opt / local / lib / libicui18n.dylib ld：警告：忽略文件/opt/local/Library/Frameworks/R.framework/R，文件是为x86_64构建的，而不是被链接的体系结构（i386）：/ opt / local / Library / Frameworks / R.framework / [R
所以我认为原因是opt/local中libiconv的架构不兼容，导致make回到usr/lib中的过时libiconv。这很奇怪，因为我的机器应该在x86_64而不是i386上运行。然后我尝试了export ARCHFLAGS="-arch x86_64"并使用端口重新安装了libiconv。这解决了这个问题。
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我已经卸载了已安装的版本pip，并从下载源extension上的源python setup.py install安装。 FWIW也不使用Anaconda。