在MacOS上安装rpy2

Question

我一直在尝试在MacOS Sierra上为python 3.6安装RPy2，但是pip安装失败而未编译。

安装错误并显示以下消息：

  clang: error: unsupported option '-fopenmp'
  error: command 'clang' failed with exit status 1

对安装的任何帮助将不胜感激。

Answer 1

在this线程中找到了解决方案。

env CC=/usr/local/Cellar/gcc/X.x.x/bin/gcc-X pip install rpy2

通过将gcc版本替换为计算机上的最新版本来运行上述命令可以解决该问题。例如，在我的Mac上，我运行了

env CC=/usr/local/Cellar/gcc/8.2.0/bin/gcc-8 pip install rpy2

Answer 2

如果使用Miniconda环境，则可以：

conda install -c r rpy2

来自：https://anaconda.org/r/rpy2

• macOS Mojave

• Python 3.8

Answer 3

我相信，如果您安装了python软件包wheel，则pip install应该会获取OS X的预编译二进制文件。