Question

许多次问过类似的问题，但不幸的是，我再次遇到使用Cython和Numpy的问题。拿这个最小的例子（几乎遵循例子here）：

# file test.pyx
import numpy as np
#cimport numpy as np

def func():
    print("hello")

我试图建立：

from distutils.core import setup
from Cython.Build import cythonize
import numpy as np
import os

os.environ["CC"] = "g++-7"

setup(
    ext_modules = cythonize("test.pyx", include_path = [np.get_include()])
)

此示例有效（python setup.py build_ext --inplace），直到我取消评论cimport ...行，之后我得到了众所周知的错误：

致命错误：numpy / arrayobject.h：没有这样的文件或目录

np.get_include()返回的路径确实有arrayobject.h标头，但在执行的实际g++命令中，包含目录缺少-I/...：< / p>

g ++ - 7 -Wno-unused-result -Wsign-compare -Wunreachable-code -fno-common -dynamic -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -Wstrict-prototypes -I / usr / local / include -I / usr / local / opt / openssl / include -I / usr / local / opt / sqlite / include -I / usr / local / Cellar / python3 / 3.6.1 / Frameworks / Python.framework / Versions / 3.6 / include / python3 .6m -c test.c -o build / temp.macosx-10.11-x86_64-3.6 / test.o

知道什么可能导致这个问题吗？

我在Mac OS上使用Python 3.6.1，所有内容（Cython，Numpy，..）都安装了pip3和Cython 0.25.2。

Answer 1

使用

代替简单的cythonize命令

ext_modules = cythonize((Extension("test", sources=["test.pyx"], include_dirs=[np.get_include()], ), ))

这里给include_dirs选项＆＃34;扩展＆＃34;而不是使用include_path和＃34; cythonize＆＃34;。

Answer 2

我的解决方法：

os.environ["C_INCLUDE_PATH"] = np.get_include()
setup(
    ext_modules = cythonize("test.pyx")
)

带有'cimport numpy`的Cython失败

2 个答案: