我是cython(和python)的新手,我试图以我可以定义变量类型的方式导入numpy。我的理解是我必须使用“cimport numpy”,然而,它失败了,我无法从错误消息中得到任何结果。这是我的代码归结为关键部分:
此时我的实际模块除了以下内容外还包括:
cimport numpy as np
这是我的setup.py:
from distutils.core import setup
from Cython.Build import cythonize
setup(
name = "test",
ext_modules = cythonize('testcimport.pyx'),
)
这是我在编译时得到的结果:
在[1]中:%运行setup.py build_ext --inplace
编译testcimport.pyx因为它 改变。 Cythonizing testcimport.pyx运行build_ext构建 'testcimport'扩展名gcc -fno-strict-aliasing -fno-common -dynamic -arch x86_64 -isysroot /Developer/SDKs/MacOSX10.6.sdk -DNDEBUG -g -O3 -arch x86_64 -isysroot /Developer/SDKs/MacOSX10.6.sdk -I / Applications / Canopy.app / appdata / canopy-1.1 .0.1371.macosx-x86_64的/ Canopy.app /内容/包含/ python2.7 -c testcimport.c -o build / temp.macosx-10.6-x86_64-2.7 / testcimport.o发生异常,使用%tb查看完整的回溯。
SystemExit:错误:命令'gcc'以退出状态1
失败在[2]中:%tb
----------------------------------------------- ---------------------------- SystemExit Traceback(最近的电话 持续) /Applications/Canopy.app/appdata/canopy-1.1.0.1371.macosx-x86_64/Canopy.app/Contents/lib/python2.7/site-packages/IPython/utils/py3compat.pyc 在execfile中(fname,* where) 181其他: 182 filename = fname - > 183 内置 .execfile(文件名,* where)
/Users/malte/Documents/setup.py in() 4设置( 5 name =“test”, ----> 6 ext_modules = cythonize('testcimport.pyx'), 7)
/Applications/Canopy.app/appdata/canopy-1.1.0.1371.macosx-x86_64/Canopy.app/Contents/lib/python2.7/distutils/core.pyc in setup(** attrs) 167提高 168其他: - > 169提升SystemExit,“错误:”+ str(msg) 170 171 return dist
SystemExit:错误:命令'gcc'以退出状态1
失败
正如你可能从这个输出中得知的那样,我在MacOSX上使用了Canopy。
如果我使用“import numpy”而不是“cimport numpy”,一切正常,但是我不能声明变量。
谢谢!
马尔特
ps:我认为我仍然需要单独执行“import numpy”才能访问numpy中的普通python函数,但这并没有改变这个例子中的任何内容 - 我仍然得到相同的错误消息。
答案 0 :(得分:5)
你必须同时使用两者:
cimport numpy
import numpy
第一个允许您访问Numpy C API,以便您可以声明数组缓冲区和变量类型。
第二个允许您访问Numpy Python函数。
不要担心在同一个变量空间中使用相同的名称('numpy'),因为Cython会处理这个...
编辑(来自评论):似乎Cython没有找到Numpy C API ...你能尝试添加:
-I.../Python27/Lib/site-packages/numpy/core/include
到编译器命令行...(检查路径是否适合您的系统)