Question

我将在R中使用Reticulate包创建一个python接口。为了访问R中的python函数，需要安装相应的python包。

我想到了两个问题：

1）如果使用网状包，是否需要安装Anaconda包？或者仅仅安装python包就足够了吗？

2）是否可以在R中安装python包，类似于install.packages（“r_package”）？

有没有人有过这个主题的经验？提前谢谢！

Answer 1

1）R包reticulate可以使用默认的python或Anaconda2或Anaconda3。如果你想让Anaconda与R合作，你必须先安装Anaconda。安装完成后，您调用library(reticulate)，然后运行py_config()或reticulate::py_discover_config()，这将为您提供Python安装所使用的路径和环境列表。然后，一旦您了解了Python路径，就可以在use_python("/opt/miniconda2/bin/python")之后添加一行，如library(reticulate)，并且您正在开展业务。

2）安装Python包以便R（或网状）可以看到它们，你必须从终端或控制台将它们安装为常规Python包;不是R.示例：conda install numpy安装numpy，或conda install scipy安装scipy，依此类推。

我只是在Docker容器rocker/rstudio中完成所有这些操作。在标准操作系统中应该更容易。

以下是分步说明：rstudio reticulate

干杯！

Answer 2

我将在前面的答案中添加一些细微差别。

就像@ f0nzie一样，Anaconda不是包，而是包管理器。理想情况下，您将使用Anaconda创建一个环境，以帮助您进行程序包管理和版本控制。有关conda环境的文档为here。

现在，您可以将Python软件包安装到R中的anaconda软件包中。可以使用reticulate::conda_install(envname, packages)。 here可以找到conda_install()的文档。

Answer 3

如果您需要特定版本的Python模块，则在模块名称后放置==，例如以下将使用pip安装3个模块的特定版本：

reticulate::conda_install(c("PyMuPDF==1.14.20", "PyPDF2==1.26.0", "reportlab==3.5.23"),
                            envname = "myenv", pip = TRUE)

你可以通过R - Reticulate安装Python包

3 个答案: