网状无法安装python软件包

Question

我正在尝试在RStudio（Windows 10中）中运行Seurat管道，这需要安装python库“ umap-learn”（Seurat演练：https://satijalab.org/seurat/v3.0/pbmc3k_tutorial.html）。

要安装所述库，我将通过以下方式在R中使用网状库：

Error in conda_python(envname = envname, conda = conda) : 
  conda environment r-reticulate not found

我遇到以下错误：

timestamp'YYYY-MM-DD HH24:MI:SS'

我已经尝试了所有我能想到的东西：

• 为py_install提供直接指向python的路径
• 卸载/重新安装RStudio
• 卸载/重新安装Anaconda
• 试图将Anaconda添加到系统路径
• 使用Reticulate的devtools版本
• 使用use_python函数：use_python（“ C：//Users/lvlah/Anaconda3/python.exe”）

在我看来，我的同事们都没有这个问题。任何帮助将不胜感激。

Answer 1

我遇到了完全相同的问题，找到this helpful post后，我通过安装OpenSSL解决了该问题。希望它对您有用！

Answer 2

我遇到了同样的问题，这似乎是一个问题，您需要首先手动创建r-reticulate环境。我是在Anaconda Navigator中手动完成的，但您也可以在R中执行conda_create("r-reticulate")，如this tutorial中所述。