编织Rmarkdown块时不同的语言(尤其是Rcpp)不打印输出

时间:2017-06-09 12:03:04

标签: r knitr r-markdown rcpp

这适用于Rstudio,我在运行块时直接在文档中获得实时预览。但是,当我将.Rmd编织为.html时,我只得到代码的回显而没有输出。

```{r engine='Rcpp'}
#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;

// [[Rcpp::export]]
int main() {
  return 4;
}

/*** R
main()
*/
```

但是,如果我对python做同样的事情,我会在编织时获得正确的输出:

```{r engine='python'}
print("abc")
```

1 个答案:

答案 0 :(得分:5)

不幸的是,注释标记(/***R */)执行因为你注意到它的执行方式而不会被保留。你可以说这是一个rmarkdown小问题;但是,/***R */更适合在交互式开发过程中嵌入调用。

此外,使用int main()是一个很大的禁忌。引用Dirk:

  

您不能只将 R 上下文放入独立的main(),因为 R 上下文需要 R

因此,我选择将函数名称更改为toad()

为了达到相同的结果并且对于有文化的编程,每个部分都应嵌入到单独的代码块中。也就是说,您必须创建一个 Rcpp 代码块(最好是启用缓存)和一个 R 代码块,其中包含实际的函数调用。

e.g。

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title: Test Doc
author: JJB
date: 6/9/2017
output: html_document
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```{Rcpp hpc-code, cache = TRUE}
#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;

// [[Rcpp::export]]
int toad() {
  return 4;
}
```

```{r interactive-output}
toad()
```

Sample output