Question

我想打印一个没有截断的numpy数组。我见过其他解决方案，但那些似乎不起作用。

以下是代码段：

total_list = np.array(total_list)
np.set_printoptions(threshold=np.inf)
print(total_list)

这就是输出的样子：

22        A
23        G
24        C
25        T
26        A
27        A
28        A
29        G
         ..
232272    G
232273    T
232274    G
232275    C
232276    T
232277    C
232278    G
232279    T

这是整个代码。我可能在打字时犯了一个错误。

import csv
import pandas as pd
import numpy as np



seqs = pd.read_csv('BAP_GBS_BTXv2_imp801.hmp.csv')
plts = pd.read_csv('BAP16_PlotPlan.csv')

required_rows = np.array([7,11,14,19,22,31,35,47,50,55,58,63,66,72,74,79,82,87,90,93,99])
total_list = []


for i in range(len(required_rows)):
    curr_row = required_rows[i];
    print(curr_row)
    for j in range(len(plts.RW)):
        if(curr_row == plts.RW[j]):
            curr_plt = plts.PI[j]
            curr_range = plts.RA1[j]
            curr_plt = curr_plt.replace("_", "").lower()
            if curr_plt in seqs.columns:
                new_item = [curr_row,curr_range,seqs[curr_plt]]
                total_list.append(new_item)
                print(seqs[curr_plt]) 


total_list = np.array(total_list)
'''
np.savetxt("foo.csv", total_list[:,2], delimiter=',',fmt='%s')
total_list[:,2].tofile('seqs.csv',sep=',',format='%s')
'''
np.set_printoptions(threshold='nan')

print(total_list)

Answer 1

使用以下代码段获取无省略号。

import numpy
numpy.set_printoptions(threshold=numpy.nan)

或

numpy.set_printoptions(threshold='nan')

修改

如果您有pandas.DataFrame，请使用以下代码段打印您的数组：

def print_full(x): pd.set_option('display.max_rows', len(x)) print(x) pd.reset_option('display.max_rows')

或者您可以使用pandas.DataFrame.to_string()方法获得所需的结果。

Answer 2

您可以通过将其更改为list来解决奇怪的Numpy repr / print行为：

print list(total_list)

应该打印出2元素np数组的列表。

Answer 3

你不打印numpy数组。

导入后添加以下行：

pd.set_option('display.max_rows', 100000)

Answer 4

#for a 2d array
def print_full(x):
    dim = x.shape
    pd.set_option('display.max_rows', dim[0])#dim[0] = len(x)
    pd.set_option('display.max_columns', dim[1])
    print(x)
    pd.reset_option('display.max_rows')
    pd.reset_option('display.max_columns')

Answer 5

似乎从Python 3开始，阈值不再是无限的。

因此，推荐的选项是：

import numpy
import sys
numpy.set_printoptions(threshold=sys.maxsize)

打印没有省略号的numpy数组

5 个答案: