在Bokeh中更改和弦图的调色板

时间:2017-05-24 20:27:26

标签: python graph visualization bokeh chord-diagram

我正在使用Bokeh库生成和弦图。图表本身或多或少都很好,但我很难弄清楚如何更改调色板。据我所知,Bokeh中的大多数图表都有一个可选的palette参数,但添加它不会改变调色板。我错过了什么吗?

import bokeh
from bokeh.charts import Chord
from bokeh.io import show, output_file
from bokeh.palettes import inferno

chord_diagram = Chord(forchord, source='nameA', target='nameB', palette= inferno(256))
show(chord_diagram)

如果某些数据有帮助:

nameA_lst = ['Creb5','Creb5','JDP2(var.2)','JDP2(var.2)',
             'Creb5','JDP2(var.2)','ATF7','ATF','ATF7','Creb5']
nameB_lst = ['STAT3','STAT1','STAT3','STAT1','Stat4',
             'Stat4','STAT3','STAT1','Stat4','Stat5a::Stat5b']
forchord = pd.DataFrame({'nameA': nameA_lst, 'nameB': nameB_lst})
forchord.head()
    nameA   nameB
0   Creb5   STAT3
1   Creb5   STAT1
2   JDP2(var.2) STAT3
3   JDP2(var.2) STAT1
4   Creb5   Stat4

2 个答案:

答案 0 :(得分:0)

Chord不使用调色板,它使用这样的色轮:

enter image description here

答案 1 :(得分:0)

可接受的答案有些过时,因为bokeh.charts已过时(What to use instead of bokeh.charts),相反,您可以使用使用色彩映射表的Holoview,如此处所述:http://holoviews.org/user_guide/Colormaps.html