ImpulseDE2，矩阵计数包含非整数元素

Question

可能这是一个愚蠢的问题（但请耐心等待，我是R＆＃39的初学者）......我正在使用ImpulseDE2，这是一个专为RNAseq数据分析而设计的软件包不同的时间（有关详细信息，请参阅article）。

运行功能（ runImpulseDE2 ）需要矩阵计数和注释数据框。我已经创建了两个，但它出现了以下错误消息：

checkCounts中的错误（matCountData，＆＃34; matCountData＆＃34;）：错误：matCountData包含非整数元素。需要计数数据。

我尝试了一些解决方案，但似乎没有任何效果（我在互联网上找不到任何解决方案）......

• as.matrix（data）
• （数据+ 1）＆gt;并且没有NAs也没有零值导致此错误（$ which(is.na(data))和$ which(data < 1)，但两个结果都是integer(0)）
• as.numeric（data）＆gt;并出现另一个错误：错误：[matCountData的Rownames]未作为输入提供。

我认为这是我没有意识到的事情，但我完全被锁定了。每个提示都将受到欢迎！

Answer 1

这是（愚蠢的）解决方案！这个函数似乎不接受浮点数...所以应用一个简单的 round 就足以解决这个错误。

感谢您的帮助！