Question

我正在从Mathematica切换到R，但我发现可视化方面存在一些困难。

我正在尝试按如下方式进行热图：

short 
   penetration scc          pi0
1            0   0  0.002545268
2            5   0 -0.408621176
3           10   0 -0.929432006
4           15   0 -1.121309680
5           20   0 -1.587298317
6           25   0 -2.957853131
7           30   0 -5.123329738
8            0  50  1.199748327
9            5  50  0.788581883
10          10  50  0.267771053
11          15  50  0.075893379
12          20  50 -0.390095258
13          25  50 -1.760650073
14          30  50 -3.926126679
15           0 100  2.396951386
16           5 100  1.985784941
17          10 100  1.464974112
18          15 100  1.273096438
19          20 100  0.807107801
20          25 100 -0.563447014
21          30 100 -2.728923621

mycol <- c("navy", "blue", "cyan", "lightcyan", "yellow", "red", "red4")

ggplot(data = short, aes(x = penetration, y = scc)) +
  geom_tile(aes(fill = pi0)) +
  scale_fill_gradientn(colours = mycol)

我明白了：

enter image description here

但我需要这样的事情： enter image description here

也就是说，我希望颜色在绘图表面上是连续的（降级的）而不是每个正方形的离散颜色。我在其他SO问题中看到有些人插入de数据，但我认为在ggplot调用中应该有更简单的方法（在Mathematica默认情况下完成）。

此外，我想锁定色标，使得0总是白色（因此在暖色之间分离为正值，冷色之间为负值），并且颜色分布在各个图中始终相同，与数据（因为我将对几个数据集使用相同的绘图结构）

Answer 1

您可以将geom_raster与interpolate=TRUE：

一起使用

ggplot(short , aes(x = penetration, y = scc)) +
  geom_raster(aes(fill = pi0), interpolate=TRUE) +
  scale_fill_gradient2(low="navy", mid="white", high="red", 
                       midpoint=0, limits=range(short$pi0)) +
  theme_classic()

要在所有绘图中获得与pi0的值相同的颜色映射，请在每个绘图中将limits scale_fill_gradient2参数设置为相同。例如，如果您有三个名为short，short2和short3的数据框，则可以执行以下操作：

# Get range of `pi0` across all data frames
pi0.rng = range(lapply(list(short, short2, short3), function(s) s$pi0))

然后在所有情节中的limits=pi0.rng中设置scale_fill_gradient2。

Answer 2

我会调整你的scale_fill_gradient2：

scale_fill_gradient2('pi0', low = "blue", mid = "white", high = "red", midpoint = 0)

使绘图颜色直接可比，为每个绘图添加一致limits：

scale_fill_gradient2('pi0', low = "blue", mid = "white", high = "red", midpoint = 0, limits=c('your lower limit','your upper limit'))

连续渐变色和色固定比例热图ggplot2

2 个答案: