我有以下数据框:
# my_data
id cg
1 a
2 b
3 a
3 b
4 b
4 c
5 b
5 c
5 d
6 d
我想计算cg
值的协方差。我相信我可以通过在以下矩阵上使用cov()
来获取它,其中每个单元格计算两个值cg
之间的共现次数。
# my_matrix
cg a b c d
a 2 1 0 0
b 1 4 2 1
c 0 2 2 1
d 0 1 1 2
从my_data
到my_matrix
的最快捷方式是什么?请注意,cg
包含超过700个唯一值。
如果有更好的方法来生成协方差矩阵,我也对此感兴趣。
以下是生成my_data
的代码:
my_data <- structure(list(id = c(1L, 2L, 3L, 3L, 4L, 4L, 5L, 5L, 5L, 6L),
cg = c("a", "b", "a", "b", "b", "c", "b", "c", "d", "d")),
.Names = c("id", "cg"),
class = "data.frame", row.names = c(NA, -10L))
答案 0 :(得分:1)
我们可以将crossprod
与table
crossprod(table(my_data))
# cg
#cg a b c d
# a 2 1 0 0
# b 1 4 2 1
# c 0 2 2 1
# d 0 1 1 2