RcppArmadillo + bigmemory崩溃Windows RStudio（但没有其他GUI + OS.type）

Question

我正在使用R套餐bigKRLS。 bigKRLS适用于Windows RGui，但在Windows RStudio上遇到致命错误。一些细节...

Windows RGui可以工作，但Windows RStudio遇到致命错误;使用R 3.3.0,3.3.1,3.3.3在四台不同的机器上确认; RTools 3.3和3.4遵循best practices recommended by the Coatless Professor; RStudio 1.0.136; Windows 7和8.目前，bigKRLS适用于Mac OS X Yosemite和Ubuntu 14.04的RStudio，没有问题。

bigKRLS取决于bigmemory，Rcpp，RcppArmadillo和snow（但问题是在最近添加snow之前的问题，可以通过设置bigKRLS(..., Ncores = 1)来禁用它以进行测试。

devtools::install_github('rdrr1990/bigKRLS')
library(bigKRLS)
vignette("bigKRLS_basics")

set.seed(2017)
X <- matrix(runif(60), ncol=3)
y <- X %*% 3:1 + rnorm(20)
out <- bigKRLS(y, X)
summary(out)

上面的代码产生的模型估计值以R2 = 0.663开始（我们当然估计在其他平台上有更复杂的模型）。

Windows RStudio在没有警告的情况下加载library(bigKRLS); bigKRLS()输出已成功清理数据。除此之外，这意味着 y 和 X 现在是big.matrix objects。然后第一个＆＃34;真正＆＃34;步骤：bigKRLS()调用bGaussKernel()，这是会话在两分钟左右后中止的地方。但bGaussKernel()似乎没有任何问题。如果在一秒钟内从命令行调用，bGaussKernel()运行正常。实际上，如果初始化bigKRLS()所需的每个变量，则可以在Windows RStudio中运行其所有代码。

目前，package detects when Windows RStudio is being used and safely exits the function将用户改为RGui。任何有关更好的解决方法的建议都将不胜感激！

Answer 1

首先，Windows上的问题与编译器无关。如果您设法正确安装了RTools，那么使用 RGUI 的一切进展顺利。相反，您遇到的问题似乎是RStudio对其应用程序使用了Boost，这些应用程序意外地污染了boost rsession命名空间中对rstudio_boost命名空间的调用过程。 RStudio，更是如此@kevinushey，最近通过创建一个位于>=1.1.129内的RStudio Boost的自定义构建来解决这个问题。可以在BH更深入地找到此错误的详细信息和解决方案。

长话短说，如果确实如此，只需检查RStudio版本是否isRStudio()就足够了。为此，您首先需要获得https://github.com/rstudio/rstudio/pull/1061。有了这个，我们可以参考@DirkEddelbuettel为其出色的RStudio daily version包导出的解决方案。具体来说，为了解决这个问题，他添加了一个简短的isRStudio <- if (Sys.getenv("RSTUDIO", unset="0") == "1" && exists("RStudio.Version") && ## the following is evil but keeps R CMD check off our back eval(parse(text=paste("RStudio.Version()$Version", ">=", "\"1.1.129\"")))) TRUE else FALSE 函数anytime和on package load。

使用calls the function each time before handing data off into C++ @DirkEddelbuettel用作：

eval(parse(text=...))

注意：使用.onLoad: no visible global function definition for ‘RStudio.Version’ Undefined global functions or variables: RStudio.Version 是为了避免遇到包检查问题，例如......

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