如何使用e1071计算数据点到svm创建的决策超平面的距离

时间:2017-03-28 21:27:35

标签: r machine-learning svm distance

我使用e1071软件包创建了一个预测2个类的线性模型。我现在能够预测类,但我也想知道每个预测与决策超平面的距离。

此代码子集虹膜数据,创建训练集和预测集:

# The data should have 2 factors, such that there is only 1 hyperplane
iris.subset <- subset(iris, iris$Species %in% c("versicolor", "virginica"))
iris.subset$Species <- as.factor(as.character(iris.subset$Species))
# Random sampling for training data
training.data <- iris.subset[sample(1:nrow(iris.subset), 50, replace=FALSE),]
# Remaining samples make up the prediction data
prediction.data <- iris.subset[!(rownames(iris.subset) %in% rownames(training.data)),]

此代码适合模型。:

require(e1071)
svmfit <- svm(Species~., data=training.data, kernel="linear")

预测预测集中的5个样本:

predict(svmfit, prediction.data[sample(1:nrow(prediction.data), 5, replace=FALSE),])

这给了我上课。现在,我想计算这些点到超平面的距离。我该怎么做?

Here是一个没有答案的同类问题,但在Matlab中。 Here是另一个可能有帮助的页面,但在Matlab中也是如此。

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

您可以使用

从预测中获取决策值
getSupportedAnnotationTypes

这些值在属性中返回。您可以使用

更直接地访问数据
dd <- prediction.data[sample(1:nrow(prediction.data), 5, replace=FALSE),]
pred <- predict(svmfit, dd, decision.value=T)
pred 
#        112        139         87        108         70 
#  virginica  virginica versicolor  virginica versicolor 
# attr(,"decision.values")
#     virginica/versicolor
# 112            1.9830355
# 139            0.4160704
# 87            -1.2680673
# 108            2.7181950
# 70            -2.6954507

返回值矩阵。

有关详细信息,请参阅attr(pred, "decision.values")

的帮助页面