我一直在学习PRIMER中的多变量分析，但现在想要使用vegan包转换为R.我希望在capscale()中使用vegan函数，但我不确定如何预先格式化我的数据。
在小插图http://cc.oulu.fi/~jarioksa/softhelp/vegan/html/capscale.html中的示例中，dataframes（varespec和varechem）都只有数值，但我有一个dataframe依赖（数字）值和另一个独立（因子）值。所以我要求的是一个可以模仿的替代工作示例。我在网上找不到任何东西。
iris数据集应提供足够的玩具数据。谢谢
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您使用的插图来源非常过时：我必须将其从网上删除。 ?capscale的帮助页面应包含当前素食主义者安装中的更多最新文档。对于具有因子的独立数据，您应该能够使用任何其他受约束的排序帮助（?rda）的模型，该模型告诉您使用formula界面可以在独立数据中包含因子 - 以及formula接口是capscale中唯一允许的接口。
您应该在纯素中从capscale切换到dbrda：capscale将来可能会被弃用。