Question

我在xarray中有一个数据集，其中包含以下维度：

Dimensions:      (subject: 30, session: 5, time: 45000)
Coordinates:
  * subject      (subject) object '110' '112' '114' '117' ...
  * session      (session) object 'week1' 'week2' 'week3' ...
  * time         (time) timedelta64[ns] 00:00:00 00:00:00.040000 ...

我想将每个试用版（主题/会话组合）拆分为较小的时间段，例如分成3个15000个值的段，结果尺寸可能如下所示：

(subject: 30, session: 5, segment: 3, time: 15000)

我搜索并尝试过很多但没有成功的事情，怎么办呢？

我一直在尝试的其中一件事似乎很接近，就是创建一个新的MultiIndex并将其取消堆叠。

segment_data = np.repeat(range(3),len(ds.time)//3)
segment = xr.Variable(dims='time',data=segment_data)
newtime_data = np.tile(ds.time[:len(ds.time)//3],3)
newtime = xr.Variable(dims='time',data=newtime_data)
dsr = ds.assign_coords(segment=segment,newtime=newtime)
dsr = dsr.set_index(segment='segment',newtime='newtime')
dsr = dsr.stack(fragment=['segment','newtime'])

然而，最后一行占用了大量内存并且似乎创建了一个维度fragment: len(ds.time)**2，这似乎不对。我也不确定在此之后我必须做什么（unstack('fragment')？）。

编辑：有更多尝试让我来到这里：

x = np.repeat(range(3),15000)
y = np.tile(ds.time[:len(ds.time)//3],3)
dsr = (ds.assign_coords(segment=x,time2=y)
      .set_index(fragment=['segment','time2'])
      .unstack('fragment'))

这给出了这个：

(subject: 30, segment: 3, session: 5, time: 45000, time2: 15000)

这似乎很接近，但它并不完全存在，因为每个time2点现在有45000个值，而它应该是单个值：

dsr.isel(subject=0,segment=0,session=0,time2=0)
# (time: 45000)

编辑：我终于找到了办法，看看我的回答。欢迎提出建议！

Answer 1

首先确保您拥有两个新尺寸的标签。在这种情况下如下：

x = range(3) # 3 segments
y = ds.time[:len(ds.time)//3] # the first 1/3rd of the time labels

然后从这些标签中创建pandas MultiIndex *。

ind = pd.MultiIndex.from_product((x,y),names=('segment','new_time'))

最后，用这个新索引替换数据集中的time索引，然后取消堆叠其级别以创建两个必需的维度。

dsr = ds.assign(time=ind).unstack('time')

您可能希望使用rename重命名新维度：

dsr = dsr.rename({'new_time':'time'})

产生的尺寸：

(subject: 30, segment: 3, session: 5, time: 15000)

现在唯一的问题是维度的顺序（理想情况下segment和session应该交换）。我认为transpose会对此有所帮助，但"although the order of dimensions on each array will change, the dataset dimensions themselves will remain in fixed (sorted) order." **所以我可能会像这样生活。

_{*请注意，您将无法使用要拆分的维度的名称，因此我们在此处'new_time'。 assign}

的不必要限制

_{**我无法解释的另一个限制。}

xarray：重塑数据，拆分维度

1 个答案: