通过带有显式引用的子流程发送多个管道命令

时间:2017-03-24 11:09:18

标签: python-3.x shell subprocess pipe popen

我一直试图通过subprocess模块执行管道命令,但遇到了一些问题。

我已经看到了下面提出的解决方案,但没有一个解决了我的问题: - sending a sequence (list) of arguments - several Popen commands using subprocess.PIPE - sending a string with shell=True

我想避免使用shell=True的第三个选项,尽管它确实在我的测试系统上产生了预期的结果。

这是在终端中运行的命令,我想复制它:

tr -c "[:alpha:]" " " < some\ file\ name_raw.txt | sed -E "s/ +/ /g" | tr "[:upper:]" "[:lower:]" > clean_in_one_command.txt

此命令根据需要清除文件。它首先在输入文件上使用tr命令,该文件名称中包含空格。输出传递给sed,它会删除一些空格,然后再将内容传递给tr以使所有内容都小写。

经过几次迭代后,我最终将其全部分解为最简单的形式,实现上面的第二种方法:Popen的几个实例,使用subprocess.PIPE传递信息。这是冗长的,但希望使调试更容易:

from subprocess import run, Popen, PIPE

cmd1_func = ['tr']
cmd1_flags = ['-c']
cmd1_arg1 = [r'"[:alpha:]\"']
cmd1_arg2 = [r'" "']
cmd1_pass_input = ['<']
cmd1_infile = ['some file name_raw.txt']
cmd1 = cmd1_func + cmd1_flags + cmd1_arg1 + cmd1_arg2 + cmd1_pass_input + cmd1_infile
print("Command 1:", cmd1)    # just to see if things look fine

cmd2_func = ['sed']
cmd2_flags = ['-E']
cmd2_arg = [r'"s/ +/ /g\"']
cmd2 = cmd2_func + cmd2_flags + cmd2_arg
print("command 2:", cmd2)

cmd3_func = ['tr']
cmd3_arg1 = ["\"[:upper:]\""]
cmd3_arg2 = ["\"[:lower:]\""]
cmd3_pass_output = ['>']
cmd3_outfile = [output_file_abs]
cmd3 = cmd3_func + cmd3_arg1 + cmd3_arg2 + cmd3_pass_output + cmd3_outfile
print("command 3:", cmd3)

# run first command into first process
proc1, _ = Popen(cmd1, stdout=PIPE)
# pass its output as input to second process
proc2, _ = Popen(cmd2, stdin=proc1.stdout, stdout=PIPE)
# close first process
proc1.stdout.close()
# output of second process into third process
proc3, _ = Popen(cmd3, stdin=proc2.stdout, stdout=PIPE)
# close second process output
proc2.stdout.close()
# save any output from final process to a logger
output = proc3.communicate()[0]

然后我会简单地将输出写入文本文件,但程序没有那么远,因为我收到以下错误:

usage: tr [-Ccsu] string1 string2
       tr [-Ccu] -d string1
       tr [-Ccu] -s string1
       tr [-Ccu] -ds string1 string2
sed: 1: ""s/ +/ /g\"": invalid command code "
usage: tr [-Ccsu] string1 string2
       tr [-Ccu] -d string1
       tr [-Ccu] -s string1
       tr [-Ccu] -ds string1 string2

这表明我的论点没有正确传递。似乎'"引号都作为sed传递到"。我确实需要其中一个明确。如果我只将一个集合放入我的列表中,那么它们将被完全剥离,这也会破坏命令。

我尝试过的事情:

  1. 没有为那些我需要显式引用的字符串声明文字字符串
  2. 转义和双重转义显式引用
  3. 将整个命令作为一个列表传递到subprocess.Popensubprocess.run函数。
  4. 使用shlex包来处理引用
  5. 删除部分cmd3_pass_output = ['>']cmd3_outfile= [output_file_abs],以便只处理原始(管道)输出。
  6. 我错过了什么,或者我将被迫使用shell=True

1 个答案:

答案 0 :(得分:3)

此程序似乎可以满足您的需求。每个进程必须单独运行。在构建它们时,一个输出会通过管道输出到下一个输入。这些文件是独立处理的,并在流程的开始和结束时使用。

#! /usr/bin/env python3
import subprocess


def main():
    with open('raw.txt', 'r') as stdin, open('clean.txt', 'w') as stdout:
        step_1 = subprocess.Popen(
            ('tr', '-c', '[:alpha:]', ' '),
            stdin=stdin,
            stdout=subprocess.PIPE
        )
        step_2 = subprocess.Popen(
            ('sed', '-E', 's/ +/ /g'),
            stdin=step_1.stdout,
            stdout=subprocess.PIPE
        )
        step_3 = subprocess.Popen(
            ('tr', '[:upper:]', '[:lower:]'),
            stdin=step_2.stdout,
            stdout=stdout
        )
        step_3.wait()


if __name__ == '__main__':
    main()