估计jaccard相似度均值

Question

我正在使用网络，我正在尝试提取vertex每jaccard similarity的平均值。我正在使用igraph包计算这个。相似性指数估计每个two vertices之间的值。该网络具有177 vertices，因此177值。这可能很容易，但我还没有找到最好的方法。

Answer 1

对列（或行）求和，减1（对于与自身的顶点相似性），除以n-1行（或列）

library(igraph)
g <- make_ring(5) 
m <-similarity(g, method="jaccard")
(colSums(m)-1)/(nrow(m)-1)

#[1] 0.1666667 0.1666667 0.1666667 0.1666667 0.1666667