通过rpy2在python中导入ggplot时出现分段错误

Question

我在python中运行以下命令：

from rpy2.robjects.packages import importr
importr( 'ggplot2' )

这在python-2.7.6和rpy2-2.8.3中工作正常。但是，在python-2.7.8和rpy2-2.8.5上运行时会出现以下错误：

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/rpy2/rinterface/__init__.py:186: RRuntimeWarning: Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) : 
unable to load shared object '/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/libs/Rcpp.so':
/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/libs/Rcpp.so: undefined symbol: R_ClassSymbol
warnings.warn(x, RRuntimeWarning)
Segmentation fault (core dumped)

Answer 1

1. rpy2是一个在使用python时提供对R的访问的包。因此，首先确保在编译R时启用了R-shared库，如下所示： ./ configure --prefix = * --with-x = no --enable-R-shlib = yes
2. 确保在分发rpy2包之前指定了以下环境变量： 导出C_INCLUDE_PATH = / path / to / R / lib64 / R / include
3. 最后但并非最不重要的是，只有满足所有这些要求时才安装的那些软件包可以通过importr在python中正确导入。如果没有，您可能需要重新安装R软件包。