包Optmatch错误消息

时间:2017-02-21 02:07:01

标签: r

我正尝试在某些示例数据中使用 R optmatch 中的功能:

> tmp
  id dose        Pred
1  1    2  0.08494142
2  1    2 -0.02784262
3  1    2 -0.05284574
4  1    2 -0.07428686
5  1    3  0.04335151

可以使用以下代码重新创建:

tmp <- data.frame(id = rep(1,5), dose = c(rep(2,4),3), 
                  Pred = c(0.08494142, -0.02784262,
                           -.05284574, -0.07428686,
                           0.04335151))

当我运行代码时:

pair(x = tmp$Pred, z = tmp$dose, data=tmp, remove.unmatchables = TRUE)

我收到以下错误:

Error in toZ(z) : Treatment indicator must have exactly 2 levels not 1

然而,从数据框架可以看出,治疗指标变量剂量只有两个级别:2或3。

使用函数 getAnywhere 我可以打印出函数 toZ (由调用)的部分,可能会生成错误:

> getAnywhere(toZ)
[Lines omitted]
function (x) 
{
[Lines of code omitted]
if (length(unique(x)) != 2) {
        stop(paste("Treatment indicator must have exactly 2 levels not", 
            length(unique(x))))
}

为了证实我的怀疑,我执行以下操作:

> length(unique(tmp$dose))
[1] 2

确认治疗指标确实恰好有2个等级。我很困惑。任何帮助将不胜感激。

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

这是optmatch中的bug。我们有一个修复程序将在下一个发布的版本中。目前,解决方法是从数字处理指标构建逻辑变量。 E.g。

tmp$dose2 <- tmp$dose == 3