R - 列表到数据框

时间:2010-11-19 16:40:53

标签: r list dataframe

我有一个嵌套的数据列表。它的长度为132,每个项目都是长度为20的列表。是否有快速方法将此结构转换为具有132行和20列数据的数据框?

以下是一些可供使用的示例数据:

l <- replicate(
  132,
  list(sample(letters, 20)),
  simplify = FALSE
)

23 个答案:

答案 0 :(得分:408)

使用rbind

do.call(rbind.data.frame, your_list)

编辑:以前的版本返回data.frame的{​​{1}}而不是向量(正如@IanSudbery在评论中指出的那样)。

答案 1 :(得分:315)

假设您的列表列表名为l

df <- data.frame(matrix(unlist(l), nrow=length(l), byrow=T))

上面会将所有字符列转换为因子,为避免这种情况,你可以在data.frame()调用中添加一个参数:

df <- data.frame(matrix(unlist(l), nrow=132, byrow=T),stringsAsFactors=FALSE)

答案 2 :(得分:121)

您可以使用plyr包。 例如,表单

的嵌套列表
l <- list(a = list(var.1 = 1, var.2 = 2, var.3 = 3)
      , b = list(var.1 = 4, var.2 = 5, var.3 = 6)
      , c = list(var.1 = 7, var.2 = 8, var.3 = 9)
      , d = list(var.1 = 10, var.2 = 11, var.3 = 12)
      )

现在长度为4,l中的每个列表都包含另一个长度为3的列表。 现在你可以运行

  library (plyr)
  df <- ldply (l, data.frame)

并且应该得到与答案@Marek和@nico相同的结果。

答案 3 :(得分:85)

data.frame(t(sapply(mylistlist,c)))

sapply将其转换为矩阵。 data.frame将矩阵转换为数据框。

答案 4 :(得分:58)

假设您的列表名为L

data.frame(Reduce(rbind, L))

答案 5 :(得分:51)

data.table的功能rbindlistdo.call(rbind, list(...))的超快实现。

可以将listsdata.framesdata.tables列为输入。

library(data.table)
ll <- list(a = list(var.1 = 1, var.2 = 2, var.3 = 3)
  , b = list(var.1 = 4, var.2 = 5, var.3 = 6)
  , c = list(var.1 = 7, var.2 = 8, var.3 = 9)
  , d = list(var.1 = 10, var.2 = 11, var.3 = 12)
  )

DT <- rbindlist(ll)

这会从data.table返回data.frame个继承。

如果 真的 想要转换回data.frame,请使用as.data.frame(DT)

答案 6 :(得分:27)

tibble包有一个函数enframe(),可以通过将嵌套的list对象强制转换为嵌套的tibble来解决此问题(&#34;整洁&#34;数据框)对象。以下是R for Data Science的简要示例:

x <- list(
    a = 1:5,
    b = 3:4, 
    c = 5:6
) 

df <- enframe(x)
df
#> # A tibble: 3 × 2
#>    name     value
#>   <chr>    <list>
#>    1     a <int [5]>
#>    2     b <int [2]>
#>    3     c <int [2]>

由于您的列表l中有多个嵌套,您可以使用unlist(recursive = FALSE)删除不必要的嵌套以获取单个分层列表,然后传递给enframe()。我使用tidyr::unnest()将输出排除在一个单一级别之前&#34; tidy&#34;数据框,包含两列(一列用于组name,另一列用于组value的观察。如果您希望列宽,则可以使用add_column()添加一列,只重复值的顺序132次。然后只需spread()值。


library(tidyverse)

l <- replicate(
    132,
    list(sample(letters, 20)),
    simplify = FALSE
)

l_tib <- l %>% 
    unlist(recursive = FALSE) %>% 
    enframe() %>% 
    unnest()
l_tib
#> # A tibble: 2,640 x 2
#>     name value
#>    <int> <chr>
#> 1      1     d
#> 2      1     z
#> 3      1     l
#> 4      1     b
#> 5      1     i
#> 6      1     j
#> 7      1     g
#> 8      1     w
#> 9      1     r
#> 10     1     p
#> # ... with 2,630 more rows

l_tib_spread <- l_tib %>%
    add_column(index = rep(1:20, 132)) %>%
    spread(key = index, value = value)
l_tib_spread
#> # A tibble: 132 x 21
#>     name   `1`   `2`   `3`   `4`   `5`   `6`   `7`   `8`   `9`  `10`  `11`
#> *  <int> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr>
#> 1      1     d     z     l     b     i     j     g     w     r     p     y
#> 2      2     w     s     h     r     i     k     d     u     a     f     j
#> 3      3     r     v     q     s     m     u     j     p     f     a     i
#> 4      4     o     y     x     n     p     i     f     m     h     l     t
#> 5      5     p     w     v     d     k     a     l     r     j     q     n
#> 6      6     i     k     w     o     c     n     m     b     v     e     q
#> 7      7     c     d     m     i     u     o     e     z     v     g     p
#> 8      8     f     s     e     o     p     n     k     x     c     z     h
#> 9      9     d     g     o     h     x     i     c     y     t     f     j
#> 10    10     y     r     f     k     d     o     b     u     i     x     s
#> # ... with 122 more rows, and 9 more variables: `12` <chr>, `13` <chr>,
#> #   `14` <chr>, `15` <chr>, `16` <chr>, `17` <chr>, `18` <chr>,
#> #   `19` <chr>, `20` <chr>

答案 7 :(得分:16)

Reshape2产生的输出与上面的plyr示例相同:

library(reshape2)
l <- list(a = list(var.1 = 1, var.2 = 2, var.3 = 3)
          , b = list(var.1 = 4, var.2 = 5, var.3 = 6)
          , c = list(var.1 = 7, var.2 = 8, var.3 = 9)
          , d = list(var.1 = 10, var.2 = 11, var.3 = 12)
)
l <- melt(l)
dcast(l, L1 ~ L2)

的产率:

  L1 var.1 var.2 var.3
1  a     1     2     3
2  b     4     5     6
3  c     7     8     9
4  d    10    11    12

如果你几乎没有像素,那么你可以在1行中重做(/ recast())。

答案 8 :(得分:10)

根据列表的结构,有一些tidyverse选项可以很好地用于不等长列表:

l <- list(a = list(var.1 = 1, var.2 = 2, var.3 = 3)
        , b = list(var.1 = 4, var.2 = 5)
        , c = list(var.1 = 7, var.3 = 9)
        , d = list(var.1 = 10, var.2 = 11, var.3 = NA))

df <- dplyr::bind_rows(l)
df <- purrr::map_df(l, dplyr::bind_rows)
df <- purrr::map_df(l, ~.x)

# all create the same data frame:
# A tibble: 4 x 3
  var.1 var.2 var.3
  <dbl> <dbl> <dbl>
1     1     2     3
2     4     5    NA
3     7    NA     9
4    10    11    NA

您还可以混合矢量和数据帧:

library(dplyr)
bind_rows(
  list(a = 1, b = 2),
  data_frame(a = 3:4, b = 5:6),
  c(a = 7)
)

# A tibble: 4 x 2
      a     b
  <dbl> <dbl>
1     1     2
2     3     5
3     4     6
4     7    NA

答案 9 :(得分:9)

延伸@ Marek的答案:如果你想避免将字符串转化为因素而效率不是问题,请尝试

do.call(rbind, lapply(your_list, data.frame, stringsAsFactors=FALSE))

答案 10 :(得分:9)

对于深层嵌套列表的一般情况,其中包含3个或更多级别,例如从嵌套JSON中获取的列表

{
"2015": {
  "spain": {"population": 43, "GNP": 9},
  "sweden": {"population": 7, "GNP": 6}},
"2016": {
  "spain": {"population": 45, "GNP": 10},
  "sweden": {"population": 9, "GNP": 8}}
}

首先考虑melt()将嵌套列表转换为高格式的方法:

myjson <- jsonlite:fromJSON(file("test.json"))
tall <- reshape2::melt(myjson)[, c("L1", "L2", "L3", "value")]
    L1     L2         L3 value
1 2015  spain population    43
2 2015  spain        GNP     9
3 2015 sweden population     7
4 2015 sweden        GNP     6
5 2016  spain population    45
6 2016  spain        GNP    10
7 2016 sweden population     9
8 2016 sweden        GNP     8

接着是dcast()然后再次变宽到一个整洁的数据集,其中每个变量形成一个列,每个观察形成一行:

wide <- reshape2::dcast(tall, L1+L2~L3) 
# left side of the formula defines the rows/observations and the 
# right side defines the variables/measurements
    L1     L2 GNP population
1 2015  spain   9         43
2 2015 sweden   6          7
3 2016  spain  10         45
4 2016 sweden   8          9

答案 11 :(得分:8)

更多答案,以及此问题答案的时间安排: What is the most efficient way to cast a list as a data frame?

最快的方法是,不会产生带有列表而不是列向量的数据框(来自Martin Morgan的答案):

l <- list(list(col1="a",col2=1),list(col1="b",col2=2))
f = function(x) function(i) unlist(lapply(x, `[[`, i), use.names=FALSE)
as.data.frame(Map(f(l), names(l[[1]])))

答案 12 :(得分:7)

有时您的数据可能是相同长度的矢量列表列表。

lolov = list(list(c(1,2,3),c(4,5,6)), list(c(7,8,9),c(10,11,12),c(13,14,15)) )

(内部向量也可以是列表,但我正在简化以使其更易于阅读)。

然后您可以进行以下修改。请记住,您可以一次取消一个级别:

lov = unlist(lolov, recursive = FALSE )
> lov
[[1]]
[1] 1 2 3

[[2]]
[1] 4 5 6

[[3]]
[1] 7 8 9

[[4]]
[1] 10 11 12

[[5]]
[1] 13 14 15

现在使用其他答案中提到的您最喜欢的方法:

library(plyr)
>ldply(lov)
  V1 V2 V3
1  1  2  3
2  4  5  6
3  7  8  9
4 10 11 12
5 13 14 15

答案 13 :(得分:7)

此方法使用tidyverse包( purrr )。

清单:

x <- as.list(mtcars)

将其转换为数据框(更具体地说是tibble):

library(purrr)
map_df(x, ~.x)

答案 14 :(得分:4)

l <- replicate(10,list(sample(letters, 20)))
a <-lapply(l[1:10],data.frame)
do.call("cbind", a)

答案 15 :(得分:4)

这最终对我有用:

do.call("rbind", lapply(S1, as.data.frame))

答案 16 :(得分:2)

对于使用purrr系列解决方案的并行(多核,多会话等)解决方案,请使用:

library (furrr)
plan(multisession) # see below to see which other plan() is the more efficient
myTibble <- future_map_dfc(l, ~.x)

其中l是列表。

要对最有效的plan()进行基准测试,可以使用:

library(tictoc)
plan(sequential) # reference time
# plan(multisession) # benchamark plan() goes here. See ?plan().
tic()
myTibble <- future_map_dfc(l, ~.x)
toc()

答案 17 :(得分:1)

我发现的所有解决方案似乎仅在list中的每个对象都具有相同的length时才适用。当list中的对象data.frame不等于length时,我需要将list转换为length。以下是我想到的基本R解决方案。毫无疑问,这是非常低效的,但它确实起作用了。

x1 <- c(2, 13)
x2 <- c(2, 4, 6, 9, 11, 13)
x3 <- c(1, 1, 2, 3, 3, 4, 5, 5, 6, 7, 7, 8, 9, 9, 10, 11, 11, 12, 13, 13)
my.results <- list(x1, x2, x3)

# identify length of each list
my.lengths <- unlist(lapply(my.results, function (x) { length(unlist(x))}))
my.lengths
#[1]  2  6 20

# create a vector of values in all lists
my.values <- as.numeric(unlist(c(do.call(rbind, lapply(my.results, as.data.frame)))))
my.values
#[1]  2 13  2  4  6  9 11 13  1  1  2  3  3  4  5  5  6  7  7  8  9  9 10 11 11 12 13 13

my.matrix <- matrix(NA, nrow = max(my.lengths), ncol = length(my.lengths))

my.cumsum <- cumsum(my.lengths)

mm <- 1

for(i in 1:length(my.lengths)) {

     my.matrix[1:my.lengths[i],i] <- my.values[mm:my.cumsum[i]]

     mm <- my.cumsum[i]+1

}

my.df <- as.data.frame(my.matrix)
my.df
#   V1 V2 V3
#1   2  2  1
#2  13  4  1
#3  NA  6  2
#4  NA  9  3
#5  NA 11  3
#6  NA 13  4
#7  NA NA  5
#8  NA NA  5
#9  NA NA  6
#10 NA NA  7
#11 NA NA  7
#12 NA NA  8
#13 NA NA  9
#14 NA NA  9
#15 NA NA 10
#16 NA NA 11
#17 NA NA 11
#18 NA NA 12
#19 NA NA 13
#20 NA NA 13

答案 18 :(得分:0)

以下简单命令对我有用:

myDf <- as.data.frame(myList)

参考(Quora answer

> myList <- list(a = c(1, 2, 3), b = c(4, 5, 6))
> myList
$a
[1] 1 2 3

$b
[1] 4 5 6

> myDf <- as.data.frame(myList)
  a b
1 1 4
2 2 5
3 3 6
> class(myDf)
[1] "data.frame"

但是,如果将列表转换为数据框的方式不明显,则会失败:

> myList <- list(a = c(1, 2, 3), b = c(4, 5, 6, 7))
> myDf <- as.data.frame(myList)
Error in (function (..., row.names = NULL, check.rows = FALSE, check.names = TRUE,  : 
  arguments imply differing number of rows: 3, 4

答案 19 :(得分:0)

如何将map_函数与for循环一起使用?这是我的解决方案:

list_to_df <- function(list_to_convert) {
  tmp_data_frame <- data.frame()
  for (i in 1:length(list_to_convert)) {
    tmp <- map_dfr(list_to_convert[[i]], data.frame)
    tmp_data_frame <- rbind(tmp_data_frame, tmp)
  }
  print(tmp_data_frame)
}

其中map_dfr将每个列表元素转换为一个data.frame,然后rbind将它们完全合并在一起。

在您的情况下,我想应该是:

converted_list <- list_to_df(l)

答案 20 :(得分:0)

尝试collapse::unlist2d(“不列出data.frame”的缩写):

l <- replicate(
  132,
  list(sample(letters, 20)),
  simplify = FALSE
)

library(collapse)
head(unlist2d(l))
  .id.1 .id.2 V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9 V10 V11 V12 V13 V14 V15 V16 V17 V18 V19 V20
1     1     1  e  x  b  d  s  p  a  c  k   z   q   m   u   l   h   n   r   t   o   y
2     2     1  r  t  i  k  m  b  h  n  s   e   p   f   o   c   x   l   g   v   a   j
3     3     1  t  r  v  z  a  u  c  o  w   f   m   b   d   g   p   q   y   e   n   k
4     4     1  x  i  e  p  f  d  q  k  h   b   j   s   z   a   t   v   y   l   m   n
5     5     1  d  z  k  y  a  p  b  h  c   v   f   m   u   l   n   q   e   i   w   j
6     6     1  l  f  s  u  o  v  p  z  q   e   r   c   h   n   a   t   m   k   y   x

head(unlist2d(l, idcols = FALSE))
  V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9 V10 V11 V12 V13 V14 V15 V16 V17 V18 V19 V20
1  e  x  b  d  s  p  a  c  k   z   q   m   u   l   h   n   r   t   o   y
2  r  t  i  k  m  b  h  n  s   e   p   f   o   c   x   l   g   v   a   j
3  t  r  v  z  a  u  c  o  w   f   m   b   d   g   p   q   y   e   n   k
4  x  i  e  p  f  d  q  k  h   b   j   s   z   a   t   v   y   l   m   n
5  d  z  k  y  a  p  b  h  c   v   f   m   u   l   n   q   e   i   w   j
6  l  f  s  u  o  v  p  z  q   e   r   c   h   n   a   t   m   k   y   x

答案 21 :(得分:0)

或者你可以使用 tibble 包(来自 tidyverse):

#create examplelist
l <- replicate(
  132,
  as.list(sample(letters, 20)),
  simplify = FALSE
)

#package tidyverse
library(tidyverse)

#make a dataframe (or use as_tibble)
df <- as_data_frame(l,.name_repair = "unique")



答案 22 :(得分:-1)

一种简短(但可能不是最快)的方法是使用base r,因为数据帧只是一个list of equal length vectors。因此,您的输入列表和30 x 132 data.frame之间的转换将是: df <- data.frame(l) 从那里我们可以将其转置为132 x 30矩阵,并将其转换回数据帧:

new_df <- data.frame(t(df))

单线: new_df <- data.frame(t(data.frame(l)))

行名看起来很烦人,但您始终可以使用以下名称重命名

rownames(new_df) <- 1:nrow(new_df)