具有自定义距离函数或预先计算的距离矩阵的kmeans

Question

我正在使用Python 2.7并且需要为某些数据创建k表示绘图。

数据并不简单，我需要用一些自定义距离函数（这是复杂的遗传数据）来计算数据样本之间的距离，然后在其上运行k表示。

我已经设法在scipy中使用h.clustering，在预先计算距离函数然后传递它而不是数据时。

我找到了how to run the k-means with sklearn，但我找不到如何使用自己的距离函数。

我对sklearn没有任何偏好，也欢迎其他套餐。