如何计算图像中“绿点”的数量？

Question

您好 我有一堆图像。让我们假设所有这些都具有相同的大小。 图像具有黑色背景和一些准圆形绿色斑点 代表荧光。我必须计算金额（百分比） 每个图像的荧光。即绿地面积。

知道如何做到这一点，例如在Java中吗？

Answer 1

这是图像处理中的标准问题，称为图像分割。您将能够找到大量有关它的信息。

特别是，这是显微图像处理中的常见问题，这正是您正在做的事情。我认为可以在ImageJ中进行预制操作;如果没有，它将是ImageJ中一个相当简单的宏，并且由于ImageJ在java中，如果你愿意，你可以使用ImageJ的库编写java代码。

我建议你采用一种方法：

1. 预处理图像以进行清理 - 通过减去中值滤波器或高斯卷积来减去背景，减去邻域大于你的单元格，或滚球算法（在ImageJ源中查找）或类似的东西，也许然后是少量模糊（例如，带有3x3邻域的中值滤波器）以去除斑点。
2. 计算图像的直方图
3. 在直方图中搜索两个峰，一个对应于黑色像素，一个对应绿色
4. 使用两个峰的值来播种双簇K-means（2-means，我猜！）分割

而不是做K-means步骤，你可以从直方图中选择一个阈值（在两个峰值之间寻找谷值，比如说），并在其上进行分段。或者使用某种自适应分割（比较像素与其邻域的中位数，比如说），但这需要一些调整。

Answer 2

我现在没有时间详细介绍，但我可以为您概述这个过程：

循环播放图像

1. 将每张图片加载到BufferedImage（http://download.oracle.com/javase/6/docs/api/java/awt/image/BufferedImage.html）
2. 遍历每个像素（x，y）并获取该像素的颜色（int getRGB（int x，int y））
3. 将此颜色与参考颜色进行比较（例如，绿色为0x7FFF00）或定义一系列可接受的颜色。
4. 如果匹配，则递增计数器
5. 循环运行后，将计数器与总像素数进行比较，等等，得到百分比

（注意：这可能是一种非常天真的方式，并且有很多可能的优化，但它应该是一个开始）

Answer 3

你可以，例如使用imagemagik，请参阅http://www.imagemagick.org/discourse-server/viewtopic.php?f=1&t=16177

Answer 4

一些想法：

• 您可以进行边缘检测，然后执行hough circle transform。如果您已经知道圆的半径，这应该可以正常工作。
• 比较颜色时，您可以使用更适合模糊比较的色彩空间。例如HSV color space
• 由于您的背景为黑色，因此最简单的方法是计算亮度并应用阈值。然后计算高于阈值的像素。
• 发布计算机视觉问题时，查看输入材料总是有帮助的。