我有张量L
张量(ndarray
个对象),每个都有几个索引。我需要根据连接图收缩这些指数。
连接以((m,i),(n,j))
形式的元组列表编码,表示“与 i - 张量L[m]
的索引与 j < / em> - 张量L[n]
的索引。
如何处理非平凡连接图?第一个问题是,只要我收缩一对索引,结果就是一个不属于列表L
的新张量。但即使我解决了这个问题(例如,通过为所有张量的所有索引提供唯一标识符),也存在一个问题,即人们可以选择任何顺序来执行收缩,而某些选择会在计算中期产生不必要的巨大影响(即使最终结果很小)。建议?
答案 0 :(得分:5)
除了内存注意事项,我相信你可以通过一次调用来einsum
进行收缩,尽管你需要一些预处理。我不完全确定你的意思是“因为我收缩了一对索引,结果是一个新的张量不属于列表L
”,但我认为这样做一步收缩就能解决这个问题。
我建议使用einsum
的替代数字索引语法:
einsum(op0, sublist0, op1, sublist1, ..., [sublistout])
所以你需要做的是将索引编码为以整数序列收缩。首先,您需要首先设置一系列唯一索引,并保留另一个副本以用作sublistout
。然后,迭代连接图,您需要在必要时将合同索引设置为相同的索引,同时从sublistout
中删除合同规定的索引。
import numpy as np
def contract_all(tensors,conns):
'''
Contract the tensors inside the list tensors
according to the connectivities in conns
Example input:
tensors = [np.random.rand(2,3),np.random.rand(3,4,5),np.random.rand(3,4)]
conns = [((0,1),(2,0)), ((1,1),(2,1))]
returned shape in this case is (2,3,5)
'''
ndims = [t.ndim for t in tensors]
totdims = sum(ndims)
dims0 = np.arange(totdims)
# keep track of sublistout throughout
sublistout = set(dims0.tolist())
# cut up the index array according to tensors
# (throw away empty list at the end)
inds = np.split(dims0,np.cumsum(ndims))[:-1]
# we also need to convert to a list, otherwise einsum chokes
inds = [ind.tolist() for ind in inds]
# if there were no contractions, we'd call
# np.einsum(*zip(tensors,inds),sublistout)
# instead we need to loop over the connectivity graph
# and manipulate the indices
for (m,i),(n,j) in conns:
# tensors[m][i] contracted with tensors[n][j]
# remove the old indices from sublistout which is a set
sublistout -= {inds[m][i],inds[n][j]}
# contract the indices
inds[n][j] = inds[m][i]
# zip and flatten the tensors and indices
args = [subarg for arg in zip(tensors,inds) for subarg in arg]
# assuming there are no multiple contractions, we're done here
return np.einsum(*args,sublistout)
一个简单的例子:
>>> tensors = [np.random.rand(2,3), np.random.rand(4,3)]
>>> conns = [((0,1),(1,1))]
>>> contract_all(tensors,conns)
array([[ 1.51970003, 1.06482209, 1.61478989, 1.86329518],
[ 1.16334367, 0.60125945, 1.00275992, 1.43578448]])
>>> np.einsum('ij,kj',tensors[0],tensors[1])
array([[ 1.51970003, 1.06482209, 1.61478989, 1.86329518],
[ 1.16334367, 0.60125945, 1.00275992, 1.43578448]])
如果有多次收缩,循环中的物流变得有点复杂,因为我们需要处理所有重复项。然而,逻辑是一样的。此外,上述显然缺少检查以确保相应的指数可以签约。
事后我意识到不必指定默认sublistout
,einsum
无论如何都会使用该订单。我决定在代码中保留该变量,因为如果我们想要一个非平凡的输出索引顺序,我们必须适当地处理该变量,它可能会派上用场。
对于收缩顺序的优化,您可以在版本1.12的np.einsum
中实现内部优化(正如@hpaulj在现在删除的注释中所述)。此版本向optimize
引入了np.einsum
可选关键字参数,允许选择以内存为代价减少计算时间的缩减顺序。将'greedy'
或'optimal'
作为optimize
关键字传递将使numpy按尺寸大小的大致递减顺序选择收缩顺序。
optimize
关键字的可用选项来自显然未记录的(就在线文档而言; help()
幸运的是)函数np.einsum_path
:
einsum_path(subscripts, *operands, optimize='greedy')
Evaluates the lowest cost contraction order for an einsum expression by
considering the creation of intermediate arrays.
np.einsum_path
的输出收缩路径也可以用作optimize
np.einsum
参数的输入。在您的问题中,您担心使用的内存过多,因此我怀疑没有优化的默认值(可能更长的运行时间和更小的内存占用量)。
答案 1 :(得分:1)
可能有用:请看一下https://arxiv.org/abs/1402.0939,这是一个有效的框架,用于解决在单个函数ncon(...)
中收缩所谓的张量网络的问题。据我所知,它的实现可直接用于Matlab(可在链接中找到)和Python3(https://github.com/mhauru/ncon)。