Pandas HDFStore:省略重复

时间:2017-01-27 09:14:16

标签: python pandas hdfs hdf5 hdfstore

我有一个HDFStore,我每晚都输入数据。我想知道如果系统崩溃等,我可能会重新运行进程,所以我想确保如果一行已经存在,那么下次运行该进程时pandas不会包含它。有没有办法寻找重复项而不包含它们?

2 个答案:

答案 0 :(得分:4)

如果您的HDFStore中有唯一索引,则可以使用以下方法:

创建样本DF:

In [34]: df = pd.DataFrame(np.random.rand(5,3), columns=list('abc'))

In [35]: df
Out[35]:
          a         b         c
0  0.407144  0.972121  0.462502
1  0.044768  0.165924  0.852705
2  0.703686  0.156382  0.066925
3  0.912794  0.362916  0.866779
4  0.156249  0.625272  0.360799

将其保存到HDFStore:

In [36]: store = pd.HDFStore(r'd:/temp/t.h5')

In [37]: store.append('test', df, format='t')

在我们的DF中添加一个新行:

In [38]: df.loc[len(df)] = [-1, -1, -1]

In [39]: df
Out[39]:
          a         b         c
0  0.407144  0.972121  0.462502
1  0.044768  0.165924  0.852705
2  0.703686  0.156382  0.066925
3  0.912794  0.362916  0.866779
4  0.156249  0.625272  0.360799
5 -1.000000 -1.000000 -1.000000   # new row, which is NOT in the HDF file

选择重复行的索引:

In [40]: idx = store.select('test', where="index in df.index", columns=['index']).index

检查:

In [41]: df.query("index not in @idx")
Out[41]:
     a    b    c
5 -1.0 -1.0 -1.0

仅向HDFStore追加那些尚未保存的行:

In [42]: store.append('test', df.query("index not in @idx"), format='t')

检查:

In [43]: store.select('test')
Out[43]:
          a         b         c
0  0.407144  0.972121  0.462502
1  0.044768  0.165924  0.852705
2  0.703686  0.156382  0.066925
3  0.912794  0.362916  0.866779
4  0.156249  0.625272  0.360799
5 -1.000000 -1.000000 -1.000000   # new row has been added

答案 1 :(得分:1)

如果您的代码中有数据框,则无论如何都可以添加数据并应用于它:

.drop_duplicates()

将删除数据框中的所有重复数据。

希望有所帮助