我正在处理大型基因组数据文件。我尝试使用以下R代码处理一个:
dj_annotatedhESC<-annotate(djhESC, Nuc_hESC, "Nuc")
错误:无法分配大小为5.8 Gb的内存#debilitating error
以粗体突出显示的错误是由于核小体覆盖矢量的绝对大小。我尝试使用以下命令排除此问题:&#34; memory.limit(6000),memory.limit(8000)等。&#34;并请求不同数量的内存,但这不起作用。
虽然我想出了一个临时解决方案,通过采用最好的ChIP-Seq读取来减小Nucleosome覆盖文件的大小 - 有没有办法可以解决这个问题(也就是说我可以以某种方式为R请求更多内存,请记住我使用的是 linux集群 计算机)?