Metis - 阻止输出

Question

我正在使用图谱分区API Metis。我有一个来自节点的完整网格，并希望对此网格进行分区。在这个分区之后，cfd-solver将在多个gpu上并行运行。问题是：我需要来自metis的块输出（每个维度中相同数量的节点）。我知道，metis只是在后台使用了一个Graph。

然而，可以将块作为输出吗？

Answer 1

对你来说这可能为时已晚，但对其他人来说也许为时已晚。如果你想要一个阻塞输出，我也假设你正在使用结构化网格。

如果是这样，我们可以跟随this answer from SciComp。从METIS创建块输出的一个相当好的解决方案：

1. 创建一个封装您的块结构的新图 原始问题。也就是说，如果我们原来有一个50 ^ 3的立方体 与cubal元素连接的顶点，我们可以“重新创建”这个结构 通过与立方体元素连接的较小的10 ^ 3立方体顶点。除了 这次，顶点对应于原始问题的块。
2. 在新图表上运行METIS。
3. 将结果重新解释为METIS的块输出 原始问题。

我说这是一个“相当不错”的解决方案，因为你必须在运行METIS之前自己规定每个维度中的节点数量。所以也许你可以用某种方式自己优化这个超参数，但也许你只需要进行有根据的猜测并运行METIS提供的输出。