Question

我正在使用多方网络，特别是在这种情况下使用四方网络。首先，在NetworkX中似乎只能通过nx.complete_multipartite_graph（）来处理完整的多方网络，而不是更常见的多方网络（如果我错了请纠正我）。如有必要，我可以开始查看igraph或其他Python包。

受到James A. Foster's question的启发，我创建了一个类似于我的网络画，当然规模较小，并且具有一些功能。我只使用此代码以图形方式查看它，并帮助解释我想要做的事情。

我使用了以下命名法：第1列和第2列形成＆＃34; X二分网络＆＃34;，第2和第3列形成＆＃34; Y二分网络＆＃34;，第3和第4列构成＆＃34; Z二分网络＆＃34;，我将所有这些网络都放在不同的文件中。我想将它们整合到一个多方网络中作为这个绘图：

Quadripartite graph

（1）我该如何处理？据我了解，我不能使用nx.compose（）函数。

我发现的一个问题，至少在这个用于绘制它的代码中，是因为在我的真实网络中第1和第4列具有相同的元素！因此，如果我在两列中使用相同的名称，则NetworkX解释对我没用，这就是我在第4列中使用不同数字的原因。

（2）我该怎么办？我需要指定尽管具有相同的元素，但两个列在某种程度上是不同的。

一个重要的信息是这个图是＆＃34;临时排序的＆＃34;，即，交互按时间顺序从左到右发生，因此第1列和第4列之间的自循环是被禁止的，这列是特别的对我感兴趣。

（3）如何在第1列和第4列之间提取网络？例如，在这个小型网络中，节点6与11和14连接，节点11当然与1,2和6连接。

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt

def position_QuadriPartiteGraph(Graph, Parts):
uPos = {}
vPos = {}
for index1, agentType in enumerate(Parts):
    uPos[agentType] = index1

QG = nx.Graph()
QG.add_nodes_from([1,2,3,4,5,6,7], agentType='alfa')
QG.add_nodes_from(['a','b','c'], agentType='beta')
QG.add_nodes_from(['A','B','C','D','E','F'], agentType='gamma')
QG.add_nodes_from([8,9,10,11,12,13,14], agentType='delta')

myEdges = [(1,'a'), # beginning of bipartite network X
           (1,'b'), # X
           (2,'b'), # X
           (3,'a'), # X
           (4,'a'), # X
           (5,'a'), # X
           (6,'c'), # X
           (7,'a'), # end of bipartite network X
           ('a','A'), # beginning of bipartite network Y
           ('a','B'), # Y
           ('a','E'), # Y
           ('b','B'), # Y
           ('b','C'), # Y
           ('b','D'), # Y
           ('c','F'), # end of bipartite network Y
           ('A',8), # beginning of bipartite network Z
           ('A',9), # Z
           ('B',9), # Z
           ('B',13), # Z
           ('C',10), # Z
           ('C',11), # Z
           ('C',12), # Z
           ('D',12), # Z
           ('E',13), # Z
           ('F', 11), # Z
           ('F', 14)] # end of bipartite network Z

[QG.add_edge(u, v) for u, v in myEdges]

nx.draw(QG, pos=position_QuadriPartiteGraph(QG, ['alfa', 'beta', 'gamma', 'delta']), with_labels=True)
plt.savefig("multipartite_graph.png")
plt.show()

非常感谢您的帮助，

豪尔赫

Answer 1

我的第一个建议是将这三个网络分别保留为g1，g2和g3。另外，让g3标签与g1标签不同，比如说，使它们为负（这解决了问题（2））。然后你可以通过逐步查看g2中g1代理的邻居，g3中的g2代理等来解决你的问题（

edges14 = sum([sum([[(i,y) for y in g3.neighbors(x)] 
              for x in sum([g2.neighbors(x) for x in g1.neighbors(i) if x in g2],
                           []) if x in g3],
                    []) for i in g1],
               [])
set(edges14)
# {(5, -9), (4, -8), (5, -13), (2, -12), (1, -11), (5, -8), (6, -14), 
#  (4, -9), (2, -9), (4, -13), (2, -13), (1, -10), (3, -13), (6, -11), 
#  (1, -13), (2, -10), (3, -9), (1, -9), (7, -9), (1, -12), (7, -13), 
#  (2, -11), (3, -8), (1, -8), (7, -8)}

如何在NetworkX或igraph中使用多方图？

1 个答案: