在矩阵/位图中查找质量簇

时间:2009-01-04 22:49:06

标签: algorithm language-agnostic geometry

这是对此处发布的问题的继续: Finding the center of mass on a 2D bitmap谈到了在布尔矩阵中找到质心,正如给出的例子。

现在假设我们将矩阵扩展为这种形式:

0 1 2 3 4 5 6 7 8 9
1 . X X . . . . . .
2 . X X X . . X . .
3 . . . . . X X X .
4 . . . . . . X . .
5 . X X . . . . . .
6 . X . . . . . . .
7 . X . . . . . . .
8 . . . . X X . . .
9 . . . . X X . . .

正如您所看到的,我们现在有4个质心,用于4个不同的群集。

我们已经知道如何找到一个质心,因为只有一个存在,如果我们在这个矩阵上运行该算法,我们将在矩阵的中间得到一些点,这对我们没有帮助。

找到这些质量簇可以是一个好的,正确的和快速的算法吗?

4 个答案:

答案 0 :(得分:3)

我想我会检查矩阵中的每个点,并根据它的邻居计算它的质量。点数的质量会随着距离的平方而下降。然后,您可以选择彼此距离最小的前四个点。

这里有一些我编写的Python代码,试图说明找出每个点的质量的方法。使用示例矩阵进行一些设置:

matrix = [[1.0 if x == "X" else 0.0 for x in y] for y in """.XX......
.XXX..X..
.....XXX.
......X..
.XX......
.X.......
.X.......
....XX...
....XX...""".split("\n")]

HEIGHT = len(matrix)
WIDTH = len(matrix[0])
Y_RADIUS = HEIGHT / 2
X_RADIUS = WIDTH / 2

计算给定点的质量:

def distance(x1, y1, x2, y2):
  'Manhattan distance http://en.wikipedia.org/wiki/Manhattan_distance'
  return abs(y1 - y2) + abs(x1 - x2)

def mass(m, x, y):
  _mass = m[y][x]
  for _y in range(max(0, y - Y_RADIUS), min(HEIGHT, y + Y_RADIUS)):
    for _x in range(max(0, x - X_RADIUS), min(WIDTH, x + X_RADIUS)):
      d = max(1, distance(x, y, _x, _y))
      _mass += m[_y][_x] / (d * d)
  return _mass

注意:我在这里使用Manhattan距离(k a Cityblock,k a Taxicab Geometry),因为我不认为使用Euclidian距离增加的准确性值得调用sqrt()的成本。

迭代我们的矩阵并构建一个元组列表,如(x,y,mass(x,y)):

point_mass = []
for y in range(0, HEIGHT):
  for x in range(0, WIDTH):
    point_mass.append((x, y, mass(matrix, x, y)))

对每个点的质量列表进行排序:

from operator import itemgetter
point_mass.sort(key=itemgetter(2), reverse=True)

查看排序列表中的前9个点:

(6, 2, 6.1580555555555554)
(2, 1, 5.4861111111111107)
(1, 1, 4.6736111111111107)
(1, 4, 4.5938888888888885)
(2, 0, 4.54)
(4, 7, 4.4480555555555554)
(1, 5, 4.4480555555555554)
(5, 7, 4.4059637188208614)
(4, 8, 4.3659637188208613)

如果我们从最高到最低工作并过滤掉那些与我们已经看到的点太接近的点,我们会得到它(我正在手动完成它,因为我现在已经没时间在代码中执行它了。 。):

(6, 2, 6.1580555555555554)
(2, 1, 5.4861111111111107)
(1, 4, 4.5938888888888885)
(4, 7, 4.4480555555555554)

只需查看矩阵,这是非常直观的结果(请注意,与您的示例进行比较时坐标为零)。

答案 1 :(得分:2)

你需要一个聚类算法,这很简单,因为你只有一个二维网格,并且这些条目相互接近。您只需使用floodfill algorithm即可。拥有每个群集后,您可以在2D center of mass article.中找到该中心。

答案 2 :(得分:1)

我的第一个想法是首先找到任何具有非零值的单元格。从那里做一些泛洪填充算法,并计算发现的细胞的质心。接下来将矩阵中找到的单元格清零,然后从顶部开始。

这当然不会像谷歌那样与tuinstoel链接的方法一样扩展,但对于较小的矩阵更容易实现。

编辑:

Disjoint sets(使用路径压缩和逐级联合)在这里很有用。对于union和find-set,他们有 O α n ))时间复杂度,其中

  

α n )= min { k :A k ( 1)≥ n }。

k n )是Ackerman函数,因此α n )基本上都是 O (1)。唯一的问题是不相交的集合是项目与集合的单向映射,但是如果你要通过所有项目,这都无关紧要。

这是一个用于演示的简单python脚本:

from collections import defaultdict

class DisjointSets(object):
    def __init__(self):
        self.item_map = defaultdict(DisjointNode)

    def add(self,item):
        """Add item to the forest."""
        # It's gets initialized to a new node when
        # trying to access a non-existant item.
        return self.item_map[item]

    def __contains__(self,item):
        return (item in self.item_map)

    def __getitem__(self,item):
        if item not in self:
            raise KeyError
        return self.item_map[item]

    def __delitem__(self,item):
        del self.item_map[item]

    def __iter__(self):
        # sort all items into real sets
        all_sets = defaultdict(set)
        for item,node in self.item_map.iteritems():
            all_sets[node.find_set()].add(item)
        return all_sets.itervalues()

class DisjointNode(object):
    def __init__(self,parent=None,rank=0):
        if parent is None:
            self.parent = self
        else:
            self.parent = parent
        self.rank = rank

    def union(self,other):
        """Join two sets."""
        node1 = self.find_set()
        node2 = other.find_set()
        # union by rank
        if node1.rank > node2.rank:
            node2.parent = node1
        else:
            node1.parent = node2
            if node1.rank == node2.rank:
                node2.rank += 1
        return node1

    def find_set(self):
        """Finds the root node of this set."""
        node = self
        while node is not node.parent:
            node = node.parent
        # path compression
        root, node = node, self
        while node is not node.parent:
            node, node.parent = node.parent, root
        return root

def find_clusters(grid):
    disj = DisjointSets()
    for y,row in enumerate(grid):
        for x,cell in enumerate(row):
            if cell:
                node = disj.add((x,y))
                for dx,dy in ((-1,0),(-1,-1),(0,-1),(1,-1)):
                    if (x+dx,y+dy) in disj:
                        node.union(disj[x+dx,y+dy])
    for index,set_ in enumerate(disj):
        sum_x, sum_y, count = 0, 0, 0
        for x,y in set_:
            sum_x += x
            sum_y += y
            count += 1
        yield 1.0 * sum_x / count, 1.0 * sum_y / count

def main():
    grid = [[('.' != cell) for cell in row if not cell.isspace()] for row in (
        ". X X . . . . . .",
        ". X X X . . X . .",
        ". . . . . X X X .",
        ". . . . . . X . .",
        ". X X . . . . . .",
        ". X . . . . . . .",
        ". X . . . . . . .",
        ". . . . X X . . .",
        ". . . . X X . . .",
    )]
    coordinates = list(find_clusters(grid))
    centers = dict(((round(x),round(y)),i) for i,(x,y) in enumerate(coordinates))
    for y,row in enumerate(grid):
        for x,cell in enumerate(row):
            if (x,y) in centers:
                print centers[x,y]+1,
            elif cell:
                print 'X',
            else:
                print '.',
        print
    print
    print '%4s | %7s %7s' % ('i','x','y')
    print '-'*22
    for i,(x,y) in enumerate(coordinates):
        print '%4d | %7.4f %7.4f' % (i+1,x,y)

if __name__ == '__main__':
    main()

输出:

. X X . . . . . .
. X 3 X . . X . .
. . . . . X 4 X .
. . . . . . X . .
. X X . . . . . .
. 2 . . . . . . .
. X . . . . . . .
. . . . X X . . .
. . . . X 1 . . .

   i |       x       y
----------------------
   1 |  4.5000  7.5000
   2 |  1.2500  4.7500
   3 |  1.8000  0.6000
   4 |  6.0000  2.0000

这一点的目的是证明不相交的集合。 find_clusters()中的实际算法可以升级为更强大的算法。

<强>参考

  • 算法简介。第2版。 Cormen et.al.

答案 3 :(得分:1)

Here's一个类似的问题,算法不是那么快,还有其他几种更好的方法。