我有一个蛋白质组学数据集，我在其中比较两个条件，因此我有条件A（8个重复）和条件B（9个重复）。
在蛋白质组学中，我们并不总是对每个重复进行测量，但我们不想消除蛋白质观察（每行是蛋白质），因为8个复制品中有1个呈现NA值。
我想使用t测试，我尝试了函数na.action =“na.pass”但出现以下错误：
Error in t.test.default(x[1:8], x[9:17], paired = FALSE, na.action = "na.pass") :
not enough 'x' observations
我给你一个数据集的例子：
C1_1 C1_2 C1_3 C1_4 C1_5 C1_6 C1_7 C1_8 C2_1 C2_2 C2_3 C2_4 C2_5 C2_6 C2_7 C2_8 C2_9
Prot_1 4.42 NA 0.73 0.47 0.84 NA 1.24 0.99 1.21 0.84 0.64 0.61 0.76 0.29 0.88 4.09 1.15
Prot_2 0.56 0.30 0.30 0.27 0.18 0.48 0.59 0.20 0.36 0.40 0.44 0.49 0.33 0.67 0.30 0.50 0.75
我非常感谢你的帮助，
祝福，
朱莉娅