r:在`sapply`循环中保留警告作为向量

时间:2016-12-15 13:49:12

标签: r dplyr warnings sapply

我正在使用我自己的函数转换数据,如下所示:

my_df %>% [...] %>%
  mutate(my_result = sapply(id_column, my_function))

这里,my_function将为返回数字结果的每一行执行一些计算。这个函数不能(很容易)被矢量化,这就是我依赖sapply的原因。到目前为止,非常好。

有时候,my_function会发出警告,表示应该采取一些特定的结果。

我想捕获这些警告,并将它们添加到我的数据框中的新列中。预期结果:

id_column | ... | result | warnings 1 | ... | result1 | NA 2 | ... | result2 | "Warning: something happened on id 2" 3 | ... | result3 | NA

我怎样才能做到这一点?

2 个答案:

答案 0 :(得分:2)

我改为使用lapply,因此您可以返回一行data.frame,每次有两列,最后再次rbind数据帧列表。

df <- data.frame(a=runif(20)-0.5)

f <- function(x) {
    tryCatch ({
        data.frame(result=log(x), warning=NA)
    }, warning = function(w) {
        data.frame(result=suppressWarnings(log(x)), warning=w$message)
    })
}

res <- cbind(df, do.call(rbind, lapply(df$a, f)))

答案 1 :(得分:0)

替代@ mpjdem的答案,但留在sapply

tryCatch.W.E返回一个列表

>> tryCatch.W.E(log(-5))
$value
[1] NaN
$warning
<simpleWarning in log(-5): NaNs produced>

结合sapply,这会产生一个矩阵,原始任务可以通过

解决

my_df %>% cbind(t(sapply(.$id_column, function(x) {tryCatch.W.E(my_function(x))})))