尝试使用rpy2模块从Python脚本调用R - 帮助设置R主目录？

Question

我的目标是能够从Python 2.7脚本调用R.我首先使用easy_install来获取rpy2模块。然后我将以下命令输入我的Spyder控制台：

from rpy2.robjects.packages import importr

这引发了以下错误：

＆＃34; RuntimeError：无法确定R主目录。

尝试安装R https://www.r-project.org/，将R_HOME环境变量设置为R主目录，或者将R解释器的目录添加到PATH环境变量。＆＃34;

看起来rpy2中的R解释器找不到R，因为它不在正确的目录中？我以前曾将R和RStudio下载到我的Mac上。

我怀疑这是一个简单的修复，我希望有人可以解释这个错误消息的确切含义，以及我应该如何更新R_HOME或PATH环境变量（我不确定这些是什么，确切地说）

Answer 1

rpy2正在R中寻找可执行文件PATH。这意味着当打开终端窗口并输入R时，应该启动R终端。由于您看到该错误消息，因此可能无法找到R。

找到R的位置，并将该目录附加到您的PATH（例如，export PATH=/where/R/is:${PATH} - 如果通过点击应用图标启动Spyder，可以将其添加到~/.bashrc。