使用GenomicRanges的setdiff：没有用于将此S4类强制转换为向量的方法

Question

我正在使用带有两个GR对象的setdiff（），在我的计算机上更新R之前，我的代码工作正常：

library(GenomicFeatures)
library(data.table)
library("TxDb.Celegans.UCSC.ce6.ensGene")
txdb<-TxDb.Celegans.UCSC.ce6.ensGene
introns<-intronsByTranscript(txdb)
exons<-exons(txdb)
minimal_introns<-setdiff(unlist(introns),exons,ignore.strand=F)

但现在我有这个错误：

Error in setdiff(unlist(introns), unlist(exons), ignore.strand = F) : unused argument (ignore.strand = F)

如果我运行setdiff（）而没有ignore.strand = F我有这个：

Error in as.vector(x) : no method for coercing this S4 class to a vector

我发现了一条帖子，表明NAMESPACE文件https://stat.ethz.ch/pipermail/bioconductor/2014-September/061440.html

存在问题

但我不知道在哪里可以找到NAMESPACE文件以及如何修复它。