R没有将S4类强制转换为矢量BioConductor AnnotationDbi包的方法

时间:2016-06-01 05:16:47

标签: r s4 bioconductor

我在代码中有一个方法调用:

> MYOBJECT
PATHID2NAME map for KEGG (object of class "AnnDbBimap")

我正在运行其他人的功能并收到错误

>as.list.default(MYOBJECT) : 
 no method for coercing this S4 class to a vector

我可以在函数的源代码中看到实际调用的是

as.list(MYOBJECT)

我的预感是R没有使用正确的as.list函数,因为可能存在一些命名空间错误。如何从AnnotationDbi手动导入as.list并强制R使用它而不是它调用的任何S3方法?

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