如果调用max(x, na.rm = TRUE)
时没有非NA
值,则会返回-Inf
并发出警告。但是,在某些情况下,summarise
中的dplyr
函数不会返回警告:
library(magrittr)
library(dplyr)
df1 <- data.frame(a = c("a","b"), b = c(NA,NA))
df1 %>% group_by(a) %>% summarise(x = max(b, na.rm = TRUE))
# Three warnings, as expected.
df2 <- data.frame(a = c("a","b"), b = c(1,NA))
df2 %>% group_by(a) %>% summarise(x = max(b, na.rm = TRUE))
# No warning. Unexpected.
有趣的是,如果我重命名该功能,我会按预期收到警告:
# Pointer to same function.
stat <- max
df1 <- data.frame(a = c("a","b"), b = c(NA,NA))
df1 %>% group_by(a) %>% summarise(x = stat(b, na.rm = TRUE))
# Three warnings, as expected.
df2 <- data.frame(a = c("a","b"), b = c(1,NA))
df2 %>% group_by(a) %>% summarise(x = stat(b, na.rm = TRUE))
# Single warning, as expected.
实际上,我认为它应该是两个警告而不是三个,因为summarise
只有两个组。但我不确定内部警告系统是如何工作的,所以也许三个警告是预期的。
我的问题是:为什么summarise
在特定情况下不输出警告,如果这是预期的,为什么函数的简单重命名会改变这种行为?
我的sessionInfo()
:
R version 3.3.2 (2016-10-31)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Ubuntu 14.04.5 LTS
locale:
[1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8 LC_NUMERIC=C
[3] LC_TIME=en_US.UTF-8 LC_COLLATE=en_US.UTF-8
[5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8 LC_MESSAGES=en_US.UTF-8
[7] LC_PAPER=en_US.UTF-8 LC_NAME=C
[9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] dplyr_0.5.0.9000 magrittr_1.5
loaded via a namespace (and not attached):
[1] lazyeval_0.2.0.9000 R6_2.2.0 assertthat_0.1
[4] tools_3.3.2 DBI_0.5-1 tibble_1.2
[7] Rcpp_0.12.8
虽然我使用dplyr
的“dev”版本,但我也在CRAN中提供的版本上测试了它,结果相同。
答案 0 :(得分:6)
以下是部分诊断;证明dplyr以某种方式弄乱了对函数名max()
的引用。此外,dplyr通常在其args:lazyeval::lazydots(..., .follow_symbols=F))
上使用SE(标准评估),所以这可能会影响承诺,尽管我看不出如何:
A)group_by()
不是罪魁祸首。 df2 %>% group_by(a) %>% summarise(length(na.omit(b)))
确实证明组b正在将带有一个NA元素的向量传递给max()
B)当我们通过其限定名称base::max
引用最大值时,我们会看到警告:
> df2 %>% group_by(a) %>% summarise(x = base::max(b, na.rm = TRUE))
a x
1 a 1
2 b -Inf
Warning message:
In base::max(NA_real_, na.rm = TRUE) :
no non-missing arguments to max; returning -Inf
我检查过没有dplyr:::max()
,所以它不是命名空间阴影。
B2)同样,do.call(max, ...)
会按预期发出警告。
> df2 %>% group_by(a) %>% summarise(x = do.call(max, list(b, na.rm = TRUE)))
a x
1 a 1
2 b -Inf
Warning message:
In .Primitive("max")(NA_real_, na.rm = TRUE) :
no non-missing arguments to max; returning -Inf
C)另外,请注意dplyr通常在其args:lazyeval::lazydots(..., .follow_symbols=F))
上使用SE(标准评估),但我看不出这会导致这种情况。
C2)我尝试用:
重新创建group_by的内部结果grouped_df(as.numeric(NA), list()), na.rm=T)
并用以下内容重新创建承诺:
p <- lazyeval::lazy_dots( max, list( grouped_df(as.numeric(NA), list()), na.rm=T ) , .follow_symbols=F)
我无法用.follow_symbols=T
我对标准评估几乎一无所知,所以在http://adv-r.had.co.nz/Expressions.html#metaprogramming
上有所了解使用的版本:dplyr 0.5.0; lazyeval 0.1.10;虽然lazyeval 0.2.0是哈德利最新的
答案 1 :(得分:2)
对于max()
,可以使用混合版本,对于分组数据帧,它的工作速度要快得多,因为整个评估可以在C ++中执行,而不需要对每个组进行R回调。在dplyr 0.5.0中,当满足以下所有条件时,将触发混合版本:
logical
常数有关详细信息,请参阅hybrid vignette。
max()
的混合版本在某些方面与R实现不同:
-Inf
NA
向量即使NA
也会返回na.rm = TRUE
在您的示例中,c(NA, NA)
是logical
的向量,因此dplyr会回退到“常规”评估,每个组都有一个R回调。如果您需要原始行为,只需使用包装器或别名;混合评估员将回归常规评估:
max_ <- max
data_frame(a = NA_real_) %>% summarise(a = max_(a, na.rm = TRUE))
## # A tibble: 1 × 1
## a
## <dbl>
## 1 -Inf
## Warning message:
## In max_(a, na.rm = TRUE) : no non-missing arguments to max; returning -Inf