如何在Python中使用DEAP将GP转换为字符串并再次返回？

Question

我在遗传编程中做了一个项目，我需要能够将遗传程序（类deap.creator.Individual）转换为字符串，改变一些事情（同时保持问题100％语法上与DEAP），然后将其重新放回个体群体中以进一步进化。

但是，我只能使用from_string方法将我的字符串转换回类gp.PrimitiveTree。 创造者的唯一构造者。我个人看到盲目地生成整个群体或从现有的个体构建个体。没有方法只能从现有 gp.PrimitiveTree创建一个人。

那么，有没有人知道我该怎么做？

注意：个人是自定义的，但它是所有DEAP示例的标准，并使用

创建

creator.create("FitnessMax", base.Fitness, weights=(1.0,))
creator.create("Individual", gp.PrimitiveTree, fitness=creator.FitnessMax)

Answer 1

经过许多个小时，我相信我已经明白了这一点。

因此，我在两个DEAP模块之间感到困惑：＆＃39;创建者＆＃39;和＆＃39;工具箱＆＃39;。 为了让我创建一个具有给定PrimitiveTree的个体，我只需要这样做：

creator.Individual(myPrimativeTree)

不做的是：

toolbox.individual(myPrimativeTree)

因为它通常被设置为初始化者本身，因此不会参与。

我希望这可以在将来某个时候为某人节省相当多的时间。

Answer 2

单个字符串： str（单个）

为了从字符串创建个人：原始树具有类方法from_string： https://deap.readthedocs.io/en/master/api/gp.html#deap.gp.PrimitiveTree.from_string

在您的Deap演变中，要从字符串创建个人，您可以尝试类似的操作（请注意使用Creator和Toolbox）：

creator.Individual.from_string("add(IN1, IN2)", pset)

但是单个表达式作为一个字符串，必须与您做str（individual）时一样，在创建字符串时也要坚持使用pset。因此，在我上面的示例字符串中，我相信您将需要具有类似于以下内容的pset：

pset = gp.PrimitiveSetTyped("MAIN", [float]*2, float, "IN")
pset.addPrimitive(operator.add, [float,float], float)