将Bio.Entrez类转换为字符串

Question

我目前正在使用BioPython从PMID查询PubMed记录。然后，我将所需信息存储在名为abstract的变量中，数据类型为：

class 'Bio.Entrez.Parser.StructureElement'>

例如，如果我打印它，我会收到：

{u'AbstractText': ['Hypercholesterolemia and hypertension are frequently associated with elevated sympathetic activity. Both are independent cardiovascular ris....']}

我希望将方括号之间的文字写成字符串。我怎样才能快速有效地做到这一点？

Answer 1

我不知道您是如何从PubMed获取数据的，但如果您需要查询PubMed并获得摘要，则可以使用以下代码段。

*

<强>输出

  

'高胆固醇血症和高血压常与

有关      

...

     

高胆固醇血症高血压患者的结构性损害。'

Answer 2

您应该将其识别为Python词典：

{u'AbstractText': ['Hypercholesterolemia and hypertension are frequently associated with elevated sympathetic activity. Both are independent cardiovascular ris....']}

此处'AbstractTest'是字典键，['Hypercholesterolemia and hypertension are frequently associated with elevated sympathetic activity. Both are independent cardiovascular ris....']是其关联值。

注意['Hypercholesterolemia and hypertension are frequently associated with elevated sympathetic activity. Both are independent cardiovascular ris....']是一个包含一个字符串的Python列表（显示用点截断）。

因此my_dict['AbstractTest'][0]之类的内容会为您提供此列表中的第一个条目。