Question

我有一个包含以下尼康NIS文件的文件夹：

P00_S00.nd2
P00_S11.nd2
P01_S01.nd2
P01_S12.nd2
P02_S02.nd2
P02_S13.nd2

最多：

P10_S10.nd2
P10_S21.nd2

我想通过P（位置）将它们连接起来：

P00_S00.nd2 + P00_S11.nd2 = P00.nd2
P01_S01.nd2 + P01_S12.nd2 = P01.nd2

目前我有一个ImageJ宏需要打开两个文件：

pt = "P00"

win1 = pt + "_S00.nd2"
win2 = pt + "_S11.nd2"

selectWindow(win1);
selectWindow(win2);

run("Concatenate...", "  title=" + pt + " image1=" + win1 + " image2=" + win2 + " image3=[-- None --]");
saveAs("Tiff", "~/out/" + pt + ".tif");

如何在不手动打开文件的情况下立即处理整个文件夹？ ImageJ Macro是否具有文本解析函数以从文件名中提取迭代器？

Answer 1

您可能想要使用＆＃34;处理文件夹＆＃34;脚本模板，可从ImageJ的脚本编辑器的“模板”菜单中获得。有关详细信息，请参阅：

ImageJ维基上的batch processing page
Scripting with Fiji workshop

在批处理模式下合并两个nd2堆栈

1 个答案: