conda install

时间:2016-10-30 21:14:40

标签: r rcpp conda

我用conda安装了R

conda install -c r r-essentials

现在我无法使用Rcpp库,即使它已与r-essentials一起安装。我收到以下错误:

# using library inline to compile a C++ code on the fly
library(inline)
library(Rcpp)
src <- '
   std::vector<std::string> s;
   s.push_back("hello");
   s.push_back("world");
   return Rcpp::wrap(s);
'
hellofun <- cxxfunction(body = src, includes = '', plugin = 'Rcpp', verbose = FALSE)
cat(hellofun(), '\n')


Error in dyn.load(libLFile): unable to load shared object '/tmp/Rtmp5N7UzX/file3a485578682c.so':
  /tmp/Rtmp5N7UzX/file3a485578682c.so: undefined symbol: _ZNSt7__cxx1112basic_stringIcSt11char_traitsIcESaIcEEC1ERKS4_
Traceback:

1. cxxfunction(body = src, includes = "", plugin = "Rcpp", verbose = FALSE)
2. dyn.load(libLFile)

我认为这也会影响未包含在conda中的模块的编译,如rstan,安装失败并出现类似错误。

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

我知道这是一个旧线程,但更新了我在Github上收到的回复。

我在不同的软件包安装方面遇到了同样的错误(在我的情况下是BCP)。根据提供的解决方案/工作heredyn.load()中的错误不再出现。因此,尝试使用conda update r-essentials更新R版本可能是值得的。