将numpy列表数组转换为numpy数组

时间:2016-10-25 22:03:53

标签: python arrays numpy type-conversion

我有一些数据存储为带有dtype=object的numpy数组,我想提取一列列表并将其转换为numpy数组。这似乎是一个简单的问题,但我发现解决它的唯一方法是将整个事物重新编写为列表列表,然后将其重新设置为numpy数组。有更多的pythonic方法吗?

import numpy as np

arr = np.array([[1, ['a', 'b', 'c']], [2, ['a', 'b', 'c']]], dtype=object)
arr = arr[:, 1]

print(arr)
# [['a', 'b', 'c'] ['a', 'b', 'c']]

type(arr)
# numpy.ndarray
type(arr[0])
# list

arr.shape
# (2,)

将数组重新转换为dtype=str会引发ValueError,因为它正在尝试将每个列表转换为字符串。

arr.astype(str)
# ValueError: setting an array element with a sequence

可以将整个数组重建为列表列表,然后将其转换为numpy数组,但这似乎是一种迂回的方式。

arr_2 = np.array(list(arr))

type(arr_2)
# numpy.ndarray
type(arr_2[0])
# numpy.ndarray

arr_2.shape
# (2, 3)

有更好的方法吗?

2 个答案:

答案 0 :(得分:4)

一种方法是使用np.vstack -

之类的堆叠操作
np.vstack(arr[:, 1])

示例运行 -

In [234]: arr
Out[234]: 
array([[1, ['a', 'b', 'c']],
       [2, ['a', 'b', 'c']]], dtype=object)

In [235]: arr[:,1]
Out[235]: array([['a', 'b', 'c'], ['a', 'b', 'c']], dtype=object)

In [236]: np.vstack(arr[:, 1])
Out[236]: 
array([['a', 'b', 'c'],
       ['a', 'b', 'c']], 
      dtype='|S1')

我相信np.vstack会在内部使用np.concatenate。所以,要直接使用它,我们会有 -

np.concatenate(arr[:, 1]).reshape(len(arr),-1)

答案 1 :(得分:3)

虽然通过列表的方式比vstack

更快
In [1617]: timeit np.array(arr[:,1].tolist())
...
100000 loops, best of 3: 11.5 µs per loop
In [1618]: timeit np.vstack(arr[:,1])
...
10000 loops, best of 3: 54.1 µs per loop

vstack正在做:

np.concatenate([np.atleast_2d(a) for a in arr[:,1]],axis=0)

一些替代方案:

In [1627]: timeit np.array([a for a in arr[:,1]])
100000 loops, best of 3: 18.6 µs per loop
In [1629]: timeit np.stack(arr[:,1],axis=0)
10000 loops, best of 3: 60.2 µs per loop

请记住,对象数组只包含指向内存中其他位置的列表的指针。虽然arr的二维性质可以轻松选择第二列,但arr[:,1]实际上是一个列表列表。大多数操作都是这样处理的。 reshape之类的内容不会越过object边界。