autoplot - 如何调整加载标签?

时间:2016-10-24 16:28:47

标签: r ggplot2 ggfortify

我希望能够调整加载标签的位置,以便它们不会落在箭头顶部。但是,我不知道需要进行哪些调整。 geom_text可用于调整网站位置的位置,但我无法在str(g)中找到向量的存储位置。

library(ggplot2)
library(ggfortify)
df <- data.frame(replicate(10,sample(-10:10,10,rep=TRUE)))
names(df) <- c('up','down','left','right','circle','square','triangle','x','r1','l1')
rownames(df) <- paste('Dummy Site', seq(0,9,1))
g <- autoplot(prcomp(df[,-11], scale=TRUE), data=df,
              loadings.label=TRUE, loadings=TRUE, 
              loadings.label.size=8, loadings.colour='blue',
              label.size=5) +
     geom_text(vjust=-1, label=rownames(df)) +
     theme(plot.background=element_blank(),
           panel.background=element_rect(fill='transparent',color='black',size=1),
           legend.text=element_text(hjust=1),
           legend.key=element_blank()) 
g

我查看ggplot2::theme并查看了autoplot的帮助文档,但未找到任何关于调整标签位置的提及。如果奖励点可以根据箭头的矢量进行调整,则可以接受静态调整。

目前,情节如下: An example of what the above code generates

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

您可以按layer_data(g, 2)获取坐标。但autoplot(prcomp.obj)将其他参数传递给ggbiplot(),因此您可以使用label的参数更改loadings.labelggbiplot()位置,例如loadings.label.hjust(请参阅?ggbiplot)。

示例代码:
arrow_ends <- layer_data(g, 2)[,c(2,4)]

autoplot(prcomp(df[,-11], scale=TRUE), data=df,
         loadings.label=TRUE, loadings=TRUE, 
         loadings.label.size=8, loadings.colour='blue',
         label.size=5, loadings.label.vjust = 1.2) +     # change loadings.label position
     geom_point(data = arrow_ends, aes(xend, yend), size = 3) +  # the coordinates from layer_data(...)
     geom_text(vjust=-1, label=rownames(df)) +
     theme(plot.background=element_blank(),
           panel.background=element_rect(fill='transparent',color='black',size=1),
           legend.text=element_text(hjust=1),
           legend.key=element_blank()) 

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