ggplot省略了多边形孔

时间:2016-10-23 10:40:46

标签: r ggplot2

我很难让ggplot绘制出有洞的多边形。以下说明。首先使用git clone https://github.com/geotheory/volcano获取shapefile。下一个:

require(ggplot2); require(ggmap); require(dplyr); require(maptools)
v = readShapePoly('volcano/volcano.shp')
v@proj4string = CRS('+proj=longlat +datum=WGS84')

# confirm polygons spatially exclusive (don't overlap)
plot(t(bbox(v)), type='l', lwd=8)
plot(v, col=paste0(colorRampPalette(c('grey','red'))(8),'dd'), add=T)

enter image description here

看起来不错。如果被多个多边形遮挡,dd alpha应该使该线不可见。现在让我们试试ggplot。

d = fortify(v) %>% as_data_frame()
bb = bbox(v)
toner = get_stamenmap(c(bb[1,1], bb[2,1], bb[1,2], bb[2,2]), zoom=11, maptype='toner')
ggmap(toner) + geom_polygon(data=d, aes(long, lat, group=group, fill=id), alpha=.5)

enter image description here

中心多边形必须重叠,因为底层地图在中心完全被遮挡。让我们检查一下防空洞的强化数据:

d %>% select(id, hole) %>% table()
   hole
id  FALSE TRUE
  0   278    0
  1   715    0
  2   392  388
  3   388  331
  4   390  265
  5   265  387
  6   328  125
  7   125    0

看起来不错,所以让我们尝试单独看一下它们。

i = 3
plot(v[i,], col='red') 
ggplot(filter(d, id == i-1)) + geom_polygon(aes(long, lat, group=group, col=hole), fill=NA)
ggplot() + geom_polygon(data=filter(d, id==i-1), aes(long,lat, group=group))

enter image description here

似乎出现了问题。 ggplot似乎忽略了这些漏洞。除非是shapefile的问题。有关如何诊断/修复此问题的任何建议吗?

2 个答案:

答案 0 :(得分:4)

"hadley/ggplot2: plotting polygon shapefiles"“......,孔状态被保留,但ggplot2”不使用此信息。幸运的是,ggspatial包,"Fish & Whistle: Holes in ggplot polygons"教会了我,似乎解决了一些问题,例如重叠问题。 (“Biggin Hill”标签上方的白色区域不是由ggspatial包裹引起的,因为它在我的环境中也位于ggplot(d) + geom_polygon(aes(long, lat, group = group, fill = id))

devtools::install_github("paleolimbot/ggspatial")

library(ggspatial)

ggmap(toner) + geom_spatial(data=v, aes(fill=id), alpha=.8)

enter image description here

答案 1 :(得分:1)

我在莱索托国家的世界地图上遇到了同样的问题。通常情况下,ggplot2应该检测到洞,因为多边形的感觉是反向的(如果我记得的话,反向顺时针而不是顺时针方向)。

这里的解决方案似乎从选择中删除了漏洞。

colorsbrewer_red <-  c( "#fff5f0","#fee0d2", "#fcbba1","#fc9272", "#fb6a4a", "#ef3b2c", "#cb181d",  "#99000d")

ggmap(toner) +  
geom_polygon(data=d[!d$hole,], aes(long, lat, group=group, fill=id), alpha=.5) +
  scale_fill_manual(name = "",
                    values= colorsbrewer_red,
                    na.value = "# 808080",
                    drop=FALSE)

volcano_in_london

无论如何,如果有人知道如何直接处理geom_polygon中的洞,那就太好了。