具有重复测量和随机块的混合模型

时间:2016-10-11 17:04:30

标签: r lme4 mixed-models nlme

我正在尝试在R中复制具有随机块和重复测量的线性混合模型的SAS模型。我使用SAS的教授在SAS中为此测试编写了语法。我对SAS的了解很差,因此我在R中的尝试。我在将重复测量语法合并到我的R模型中时遇到了麻烦。请指教。

我正在研究动物丰度(模式物种)与三年内在27个网格中收集的许多栖息地变量(如灌木密度,水分,木材)之间的关系。在这三年中,夏季和春季(季节)收集了丰富的数据。

随机效果=网格

固定效果=木材,水分,灌木密度

重复措施=年份和季节

这是SAS代码:

proc mixed data=SHREWDATA ic;
class grid year season treatment;
model species= year  season  shrubdensity  moisture  &wood  &wood*year  &wood*season/htype = 3  solution     DDFM=SATTERTHWAITE ;
random grid/solution;
repeated /subject=grid(treatment); 
lsmeans year season; run;

每年和每季重复的'单位'(主题)都是网格内的处理。

这是我使用lme

尝试的R代码
modelspecies2 <- lme(modelspecies ~ year + season + shrubdensity + moisture + wood + wood * year + wood * season, random = list(~1|grid), data = SHREWDATA, method = "ML")

我还没有看到任何有关重复测量和随机混合块的混合模型的讨论。我试图合并一个重复的度量语法,但是我得到一个错误,或者没有得到与SAS中相同数据集相同的结果。

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